RNA序列数据分析中的报告工具:使用GOstats进行GO分析时出现错误

RNA序列数据分析中的报告工具:使用GOstats进行GO分析时出现错误,r,publish,bioconductor,R,Publish,Bioconductor,我只是遵循了第5页的例子 在页面末尾执行le命令行时: publish(goResults,goReport,selectedIDs=selectedIDs,annotation.db=“org.Mm.eg”,pvalueCutoff=0.05) 我得到错误: (函数(类、fdef、mtable)中出错: 找不到签名“character”的函数“keys”的继承方法 之前的PDF示例运行良好 我正在MacOS 10.14.6上使用RStudio 1.1.463,R版本3.5.3(2019-03-

我只是遵循了第5页的例子

在页面末尾执行le命令行时:
publish(goResults,goReport,selectedIDs=selectedIDs,annotation.db=“org.Mm.eg”,pvalueCutoff=0.05)

我得到错误:
(函数(类、fdef、mtable)中出错: 找不到签名“character”的函数“keys”的继承方法

之前的PDF示例运行良好

我正在MacOS 10.14.6上使用RStudio 1.1.463,R版本3.5.3(2019-03-11)

任何帮助或指导都将不胜感激

是的,安装了鼠标库org.Mm.eg.db。这就是我如何处理引用文档中前面的命令:des2Report finish(des2Report)你需要提供更多关于你为函数提供了什么的信息。例如,什么是mockRna.dse?你为selectedds提供了什么。你能做dput(head(selectedds))并粘贴它作为你的输出吗?它给出的是:>dput(head(selectedds))c(“258294”、“108637”、“383320”、“71277”、“71846”、“72413”)这些数据是在报告工具的渐晕图文档中提供的数据。有关mockRna的信息。dse:class:DESeqDataSet dim:18760 6元数据(1):版本分析(4):计数mu H cooks行名(18760):62915 100861788…100035635 100504490行数据名(22):baseMean baseVar…偏差maxCooks列名(6):case1 case2…control2 control3 colData names(2):条件sizefactor这可能是问题的一部分吗?mockRna.dse是一个deseq2对象,您直接将其传递到publish(…)中。您需要首先进行go术语扩展