String 在Linux bash中从Windows中形成的文本文件中读取内容

我正在尝试使用wget和url从数据库下载文件。例如

wget“”

所以url的格式如下：（$idnumber）.pdb“

但是我有很多文件要下载；所以我编写了一个bash脚本，从文本文件中读取id_编号，形成url字符串，然后由wget下载

!/bin/bash

while read line
do
url="http://www.rcsb.org/pdb/files/$line.pdb"
echo -e $url
wget $url
done < id_numbers.txt

所以，

.pdb

被回复为

http

。我不明白为什么。有人有想法吗？ 我如何格式化它，使url是

"http://www.rcsb.org/pdb/files/($idnumber).pdb"

?？ 非常感谢

注意。这个问题被标记为“如何在bash中连接字符串？”的重复项，但我实际上是在问其他问题。我在问这个问题之前阅读了这个问题，结果发现我的问题是在Windows中准备txt文件，而不是真正的字符串关联。我编辑了问题标题。我希望现在问题更清楚。

尝试t他的：

url="http://www.rcsb.org/pdb/files/"$line
$url=$url".pdb"

---

有关更多信息，请选中，

-e

echo选项用于输出所需内容，无需插入新行，此处不需要它

我还怀疑您包含ID的文件格式不正确，您是在哪个操作系统上创建的

无论如何，您可以通过以下方式简化脚本：

!/bin/bash

while read line
do
    wget "http://www.rcsb.org/pdb/files/$line.pdb"
done < id_numbers.txt

---

听起来您的id_numbers.txt文件具有DOS/Windows样式的行尾（回车符后跟换行符），而不是普通的unix行尾（仅换行符）。结果是，

read

认为该行以回车结束，

$line

实际上在结尾处有一个回车，这会嵌入到url中，导致各种混乱

有几种方法可以解决此问题。在使用变量时，可以使用bash修剪该变量的回车：

url="http://www.rcsb.org/pdb/files/${line%$'\r'}.pdb"

或者您可以让

read

通过告诉它回车符算作空格来修剪它（

read

将从它读取的空格中修剪前导空格和尾随空格）：

---

或者您也可以使用类似于dos2unix的命令（或操作系统上的任何等效命令）转换id_numbers.txt文件。

您可以发布几行

id_numbers.txt

吗？使用

cat-a

显示

id_numbers.txt

。此外，您几乎可以肯定读取

-r

标志，尽管在这种情况下它可能会或可能不会更改任何内容。或者id_nums.txt是在windows上创建的，并且有\r\n行结尾。Ah Gordon已经知道了这一点。

dos2unix文件

。祝大家好运。是的，我也怀疑这一点，我回答的第二句话。您好，您是对的。我在Windows的记事本++中形成了.txt文件。这导致了问题。我在那里有

echo

命令来查看我正在形成的url，以便我可以进行故障排除。感谢您的回复。在本cas中e您只需更改@Gordon所说的行分隔符（IFS）。如果您想要干净的东西，我的代码仍然有效（只需在while循环之前添加

IFS=$'\r'

）.相当于，但更长，仍然无法解决回车问题。我实际上也尝试过同样的方法：）但切普纳是对的，并不能解决回车问题。这很有效！非常感谢。我认为这是因为回车的原因，但我还没有想出如何摆脱它。非常感谢！

for i in $(0 9) ; do echo "$i" >> id_numbers.txt ; done

url="http://www.rcsb.org/pdb/files/${line%$'\r'}.pdb"

while IFS=$'\r' read line