String 从具有匹配字符串的2个文件中连接2行_String_Fasta

String 从具有匹配字符串的2个文件中连接2行

string

String 从具有匹配字符串的2个文件中连接2行,string,fasta,String,Fasta,我对Unix还是新手，但我渴望学习它。。我有2个文件，有些行有一些匹配的子字符串，我想把这些行连接成一行，而其他行保持不变。下面是一个例子文件1（fasta文件）：文件2： 292183 k__Bacteria 551166 k__Bacteria; p__Acidobacteria 所需输出： >292183 k__Bacteria AGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGACAGGCTTAACACATGCAAGTCGAGGGGCAGCGGGGAG

我对Unix还是新手，但我渴望学习它。。我有2个文件，有些行有一些匹配的子字符串，我想把这些行连接成一行，而其他行保持不变。下面是一个例子

文件1（fasta文件）：

文件2：

292183  k__Bacteria
551166  k__Bacteria; p__Acidobacteria

所需输出：

>292183 k__Bacteria
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGACAGGCTTAACACATGCAAGTCGAGGGGCAGCGGGGAGGAAGCTTGCTTTCTCTGCCGGCGACCGG CGCACGGGTGAGT
>551166 k__Bacteria; p__Acidobacteria
GTCGAGCGGCGAACGGGTGAGTAACGCGTGGATTATCTGCCCCGAGGTGGGGGATAACCCGGGGAAACTCGGGCTAATACCGCATATGACCGTGAGGTCA AAGGGGGGTCGCA

我尝试使用awk和perl来实现这一点，但我从未将它们放在一个文件中

谢谢你的帮助，顺致敬意， M

将帮助您解决问题。

>292183 k__Bacteria
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGACAGGCTTAACACATGCAAGTCGAGGGGCAGCGGGGAGGAAGCTTGCTTTCTCTGCCGGCGACCGG CGCACGGGTGAGT
>551166 k__Bacteria; p__Acidobacteria
GTCGAGCGGCGAACGGGTGAGTAACGCGTGGATTATCTGCCCCGAGGTGGGGGATAACCCGGGGAAACTCGGGCTAATACCGCATATGACCGTGAGGTCA AAGGGGGGTCGCA

sed 's/\([0-9]*\).*/s.\1.&./' File_2 | sed -f- File_1