C 从阵列数据获取平面切片
大家好, 我将三维网格数据(来自多个TIF图像)读取到结构中,如下所示:C 从阵列数据获取平面切片,c,algorithm,3d,plane,C,Algorithm,3d,Plane,大家好, 我将三维网格数据(来自多个TIF图像)读取到结构中,如下所示: typedef struct VolumeData{ int nx; int ny; int nz; unsigned char *data; // size is nx*ny*nz } 现在我想从一维网格数据中获取平面切片: 例如: 但我很难沿着其他轴执行: unsigned char* getYZPlaneStack(VolumeData *vol,int x); 及 有什么简单的算法吗? 提前感谢。C数组
typedef struct VolumeData{
int nx;
int ny;
int nz;
unsigned char *data; // size is nx*ny*nz
}
现在我想从一维网格数据中获取平面切片:
例如:
但我很难沿着其他轴执行:
unsigned char* getYZPlaneStack(VolumeData *vol,int x);
及
有什么简单的算法吗?
提前感谢。C数组在内存中总是按顺序排列的。您所追求的似乎需要在后续元素的地址之间建立更复杂的关系,而不仅仅是添加元素的大小
我认为您要么需要进一步抽象它,以便获得一个函数(
getAt()
或其他什么)来调用以索引到数组中,要么动态创建新切片并跨数组复制数据。对于您提到的返回类型,这是不可能的
我会解释的
在第一个函数中,返回一个指针,调用者需要连续压缩数据的地址。这没关系,因为原始结构支持它
对于第二个函数,如果要返回连续压缩平面的地址,则必须进行[1]重新排序,也就是说,将其复制到其他位置[2]分配内存,因为复制到其他位置,以及[3]释放内存,因为在第2步中完成了分配
如果从性能角度看复制是可以接受的,那么最好的方法是使用智能对象,它将为您处理工作。STL的std::vector可能是最好的
如果您有非常大的数据,或者性能是一个问题,那么您必须设计一种不同的方法,而不复制数据。您必须实现自定义索引器-也就是说,避免您要求的转换。第二个和第三个函数都会对数据集重新采样(它们基本上是在新的引用中表示图像) 因此,他们必须重新组织数据:
ny*nz
的新数组,为XZ创建一个大小为nx*nz
的新数组// I assume this sorting order:
// Z ^ Slices are
// / stacked along
// / the Z axis
// +-------> X
// |
// |
// Y v
// Assumes your data is stored in row major order:
// +-------> X +---------> X
// slice 0: | 0 1 2 | slice 1: | 6 7 8 | etc.
// | 3 4 5 | | 9 10 11 |
// Y v Y v
// Assumes x is the column index, y the row index, z the slice index.
// For example, you want element #9:
// - col 0 -> x = 0
// - row 1 -> y = 1
// - slice 1 -> z = 1
// I suggest you rename nx, ny, nz into nbCols, nbRows, nbSlices to make
// things explicit
index computeIndex(VolumeData *vol, int x, int y, int z)
{
int nx = vol->nx, // nb cols
ny = vol->ny, // nb rows
nz = vol->nz; // nb slices
int index = nx*ny*z // size of one slice, multiplied by slice index
+ nx*y // size of one row (nb cols), multiplied by row index
+ x; // offset in row (column index)
return index;
}
unsigned char* getYZPlaneStack(VolumeData *vol,int x)
{
int nx = vol->nx, // nb rows
ny = vol->ny, // nb columns
nz = vol->nz; // nb slices
unsigned char *newData = new unsigned char[ny*nz];
// Depth is now along the X axis
// +-----> Z
// |
// |
// Y v
for(int y = 0; y < ny; ++y) // For each row
for(int z = 0; z < nz; ++z ) // For each column
{
int i = computeIndex(vol, x, y, z);
newData[nz*y+z] = vol->data[i];
}
return newData;
}
//我假设这个排序顺序:
//Z^片是
///堆积如山
///Z轴
//+--->X
// |
// |
//Y v
//假设您的数据按行主顺序存储:
//+----------->X+----------->X
//第0部分:| 0 1 2 |第1部分:| 6 7 8 |等。
// | 3 4 5 | | 9 10 11 |
//Y v Y v
//假设x是列索引,y是行索引,z是切片索引。
//例如,您需要元素#9:
//-col 0->x=0
//-第1行->y=1
//-切片1->z=1
//我建议您将nx、ny、nz重命名为nbCols、nbRows、nbSlices,以便
//明确的事情
索引计算索引(卷数据*卷,整数x,整数y,整数z)
{
int nx=vol->nx,//nb cols
ny=vol->ny,//nb行
nz=vol->nz;//nb切片
int index=nx*ny*z//一个切片的大小,乘以切片索引
+nx*y//一行的大小(nb列),乘以行索引
+x;//行中的偏移量(列索引)
收益指数;
}
无符号字符*getYZPlaneStack(卷数据*vol,int x)
{
int nx=vol->nx,//nb行
ny=vol->ny,//nb列
nz=vol->nz;//nb切片
无符号字符*newData=新的无符号字符[ny*nz];
//深度现在沿X轴
//+--->Z
// |
// |
//Y v
for(int y=0;ydata[i];
}
返回新数据;
}
unsigned char* getXZPlaneStack(VolumeData *vol,int y);
// I assume this sorting order:
// Z ^ Slices are
// / stacked along
// / the Z axis
// +-------> X
// |
// |
// Y v
// Assumes your data is stored in row major order:
// +-------> X +---------> X
// slice 0: | 0 1 2 | slice 1: | 6 7 8 | etc.
// | 3 4 5 | | 9 10 11 |
// Y v Y v
// Assumes x is the column index, y the row index, z the slice index.
// For example, you want element #9:
// - col 0 -> x = 0
// - row 1 -> y = 1
// - slice 1 -> z = 1
// I suggest you rename nx, ny, nz into nbCols, nbRows, nbSlices to make
// things explicit
index computeIndex(VolumeData *vol, int x, int y, int z)
{
int nx = vol->nx, // nb cols
ny = vol->ny, // nb rows
nz = vol->nz; // nb slices
int index = nx*ny*z // size of one slice, multiplied by slice index
+ nx*y // size of one row (nb cols), multiplied by row index
+ x; // offset in row (column index)
return index;
}
unsigned char* getYZPlaneStack(VolumeData *vol,int x)
{
int nx = vol->nx, // nb rows
ny = vol->ny, // nb columns
nz = vol->nz; // nb slices
unsigned char *newData = new unsigned char[ny*nz];
// Depth is now along the X axis
// +-----> Z
// |
// |
// Y v
for(int y = 0; y < ny; ++y) // For each row
for(int z = 0; z < nz; ++z ) // For each column
{
int i = computeIndex(vol, x, y, z);
newData[nz*y+z] = vol->data[i];
}
return newData;
}