Image processing 二维图像的三维重建

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我有3D显微CT图像的2D切片。图像堆栈以.tif格式提供。 在本文中,使用Imaris软件进行了三维重建。我想 重现原论文中给出的结果。但是,我没有Imaris的许可证

我尝试使用3D切片器,这是一个开源软件。我可以加载图像,但无法生成3D体积。如果有人使用过此工具,我可以提供更多详细信息

我打算从分割的图像创建一个3D体积,并根据其厚度过滤骨架。 在这里,我想删除骨架的一些分支。例如,如果有500个分支,我想通过删除分支(选择特定的感兴趣区域)将其减少一个数量级。我是这个领域的初学者,我不确定哪种工具可以使用


任何关于如何进行的建议都会非常有用

如果你是新手,也许ImageJ是你的工具。@CrisLuengo非常感谢你的回复。我确实试过ImageJ。上述链接中的堆栈具有约1900个图像。我可以拖放包含图像的完整文件夹。接下来,我还可以查看所有帧的动画。不幸的是,在尝试使用3D查看器插件时,会弹出一个内存错误(我使用的是Windows 10,64位)。我也愿意接受有关MATLAB或Python库的建议。