来自java的linuxshell命令

我正在尝试从Java运行Linux命令。该命令在命令行本身中运行得非常完美，但在Java中却没有。 命令行中的命令是

curl -H "Content-Type: text/plain" -d "$(printf '#Genes\nPIK3C2A\nPTEN\nUNC5B')" -X POST --url https://reactome.org/AnalysisService/identifiers/projection/

来自Java的命令是

 String $notifyMsg="\"$(printf '#Genes\nPIK3C2A\nPTEN\nUNC5B')\"";
 String $reactome = "https://reactome.org/AnalysisService/identifiers/projection/";
 String $notifyTitle= "\"Content-Type: text/plain\"";
 String $command = "curl" + " " + "-H"+ " " +  $notifyTitle + " "+ "-d " + $notifyMsg +" "+ "-X" + " " + "POST" + " " +  " " + "--url" +" " + $reactome;
 System.out.println("Command is: " + $command);

      Process p=Runtime.getRuntime().exec($command);
      p.waitFor();
      System.out.println("Run Result " + p.exitValue() )

我被要求得到这样的输出

{"summary":{"token":"MjAxODAxMjMxNjQyMDZfNjcy","projection":true,"interactors":false,"type":"OVERREPRESENTATION","sampleName":"Genes","text":true},"expression":{"columnNames":[]},"identifiersNotFound":0,"pathwaysFound":51,"pathways":

---

但是我得到了0。谁能告诉我哪里不对吗？

引用和逃避是你的敌人。最好的办法是完全避免它们。使用一个方法启动该过程，该方法允许您将各个参数作为单独的字符串传递，而无需将它们分开

Process p = new ProcessBuilder(
    "curl",
    "-H", "Content-Type: text/plain",
    "-d", "#Genes\nPIK3C2A\nPTEN\nUNC5B",
    "-X", "POST",
    "--url", "https://reactome.org/AnalysisService/identifiers/projection/"
).start();

您的代码调用

exitValue（）

，这将为您提供进程的退出代码。要读取其输出，请从其

---

引用和逃避是你的敌人。最好的办法是完全避免它们。使用一个方法启动该过程，该方法允许您将各个参数作为单独的字符串传递，而无需将它们分开

Process p = new ProcessBuilder(
    "curl",
    "-H", "Content-Type: text/plain",
    "-d", "#Genes\nPIK3C2A\nPTEN\nUNC5B",
    "-X", "POST",
    "--url", "https://reactome.org/AnalysisService/identifiers/projection/"
).start();

您的代码调用

exitValue（）

，这将为您提供进程的退出代码。要读取其输出，请从其

p.exitValue（）

将为您提供进程的退出代码。它返回0，因为curl成功，退出代码为0

<>我会考虑在java中用这些方法来执行这些操作。p>

p.exitValue（）

将为您提供进程的退出代码。它返回0，因为curl成功，退出代码为0

---

<>我会考虑在java中用这些方法来执行这些操作。p> 这就是我的工作原理：

String notifyMsg = "#Genes\nPIK3C2A\nPTEN\nUNC5B";
String reactome = "https://reactome.org/AnalysisService/identifiers/projection/";
String notifyTitle = "Content-Type: text/plain";

Process p = new ProcessBuilder("curl", "-H", notifyTitle, "-d", notifyMsg, "-X", "POST", "--url", reactome).start();
p.waitFor();
try (Scanner scanner = new Scanner(new InputStreamReader(p.getInputStream()))) {
    while (scanner.hasNextLine()) {
        System.out.println(scanner.nextLine());
    }
}
System.out.println("Run Result " + p.exitValue());

不要手动控制命令行，请使用

ProcessBuilder的vararg构造函数

您的

内容类型

指令和

-d

$（printf

是shell解释的东西，但Java不解释。只需在Java字符串文本中使用

\n

即可获得新行

---

我还添加了一些代码来读取输出。

这就是我的工作原理：

String notifyMsg = "#Genes\nPIK3C2A\nPTEN\nUNC5B";
String reactome = "https://reactome.org/AnalysisService/identifiers/projection/";
String notifyTitle = "Content-Type: text/plain";

Process p = new ProcessBuilder("curl", "-H", notifyTitle, "-d", notifyMsg, "-X", "POST", "--url", reactome).start();
p.waitFor();
try (Scanner scanner = new Scanner(new InputStreamReader(p.getInputStream()))) {
    while (scanner.hasNextLine()) {
        System.out.println(scanner.nextLine());
    }
}
System.out.println("Run Result " + p.exitValue());

不要手动控制命令行，请使用

ProcessBuilder的vararg构造函数

您的

内容类型

指令和

-d

$（printf

是shell解释的东西，但Java不解释。只需在Java字符串文本中使用

\n

即可获得新行

---

我还添加了一些代码来读取输出。

考虑使用JToice或Apache HTTP组件或其他java库。这里不需要使用CURL。为什么要通过启动<代码> CURL< /CUD>下载文件？当有许多本地java库来执行此操作时，请考虑使用JToSE或Apache HTTP组件或其他JA。va库。您不需要在此处使用curl。当有许多本机Java库可以执行此操作时，为什么要通过启动

curl

来下载文件？