Matlab 特定空间模式下的细胞集落存活映射
我试图在给定的细胞烧瓶扫描图像中绘制细胞存活的空间图。快速背景：细胞接受了高剂量的辐射（质子/X射线），通过网格传输，因此一些区域被辐射覆盖，而其他区域则没有。扫描这些细胞菌落后，将图像输入分割算法（我使用Matlab开发了该算法），并提供每个检测到的活菌落的质心坐标（c_I=（x_I，y_I）） 我已经对网格“条纹”进行了这种类型的评估，在这种评估中，我沿着单个维度（x）计算了一条带内的菌落数，并测试了不同的带宽Δx（如下图左图所示）。然而，我的问题是网格“孔”（见下图）——在给定质心坐标的情况下，如何在二维（x和y）中对细胞集落存活进行相同类型的评估？我必须“思考”吗 提前感谢您对此问题提供的任何指导或帮助Matlab 特定空间模式下的细胞集落存活映射,matlab,image-processing,mapping,bioinformatics,spatial,Matlab,Image Processing,Mapping,Bioinformatics,Spatial,我试图在给定的细胞烧瓶扫描图像中绘制细胞存活的空间图。快速背景：细胞接受了高剂量的辐射（质子/X射线），通过网格传输，因此一些区域被辐射覆盖，而其他区域则没有。扫描这些细胞菌落后，将图像输入分割算法（我使用Matlab开发了该算法），并提供每个检测到的活菌落的质心坐标（c_I=（x_I，y_I）） 我已经对网格“条纹”进行了这种类型的评估，在这种评估中，我沿着单个维度（x）计算了一条带内的菌落数，并测试了不同的带宽Δx（如下图左图所示）。然而，我的问题是网格“孔”（见下图）——在给定质心坐标的情
你的方向是正确的。在左侧图像中，变化沿x轴，您正在使用一个新轴来提高电镀效率（y轴） 类似地，对于网格-您必须引入一个新轴：z轴。假设图像I为500x500，每个网格单元为50x50。因此，您将创建一个10x10网格G，其中G的每个单元都是I的一个50x50网格单元中的质心计数 由于可视化三维图表很困难，人们使用图像，其中z轴的值是图像中的强度或灰度图像的灰度值。确保在[0,1]或[0255]范围内对z轴值进行规格化，以便将图像用作可视化工具