Matrix 矩阵乘以MPI(分段故障)

Matrix 矩阵乘以MPI(分段故障),matrix,segmentation-fault,mpi,Matrix,Segmentation Fault,Mpi,我最近开始学习MPI,你可能已经猜到了,我已经遇到了一个我自己无法解决的错误 我想写一个将两个矩阵相乘的程序。然而,我还没有走到那一步,事实上,我一开始就坚持播放矩阵 #define MASTER 0 if (rank == MASTER) { A = (double *) malloc(N * N * sizeof(double)); B = (double *) malloc(N * N * sizeof(double)); matFillRa

我最近开始学习MPI,你可能已经猜到了,我已经遇到了一个我自己无法解决的错误

我想写一个将两个矩阵相乘的程序。然而,我还没有走到那一步,事实上,我一开始就坚持播放矩阵

#define MASTER 0
if (rank == MASTER) {
        A = (double *) malloc(N * N * sizeof(double));
        B = (double *) malloc(N * N * sizeof(double));
        matFillRand(N, A);
        matFillRand(N, B);
    }

if (rank == MASTER) {
        P = (double *) malloc(N * N * sizeof(double));
    }

matMulMPI(N, A, B, P);

if (rank == MASTER) {
        printMatrix(N, P);
}
(理论上)进行数学运算的函数如下:

void matMulMPI(long N, double *a, double *b, double *c) {
    long i, j, k;   
    int rank, size;
    MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);
    MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &size);

    MPI_Bcast(&N, 1, MPI_LONG, MASTER, MPI_COMM_WORLD);

    MPI_Bcast(b, N*N, MPI_DOUBLE, MASTER, MPI_COMM_WORLD);

    printMatrix(N, b);

    //TO-DO: Broadcast A
    //TO-DO: Do Math
}
这个广播不起作用。我得到以下信息:

*处理接收到的信号信号:分段故障(11)信号代码:无效权限(2)地址失败:0x401560信号: 分段故障(11)信号代码:权限无效(2)失败 地址:0x401560[0] /lib/x86_64-linux-gnu/libpthread.so.0(+0x10340)[0x7fc3ede6b340][1] /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6(+0x981c0)[0x7fc3edb2e1c0][2] /usr/lib/libmpi.so.1(蛋白石转换器解包+0x105)[0x7fc3ee1788d5][ 3] /usr/lib/openmpi/lib/openmpi/mca\u pml\u ob1.so(mca\u pml\u ob1\u recv\u frag\u callback\u match+0x460) [0x7fc3e6587630][4] /usr/lib/openmpi/lib/openmpi/mca_btl_sm.so(mca_btl_sm_component_progress+0x487) [0x7fc3e572a137][5]/usr/lib/libmpi.so.1(opal_进度+0x5a) [0x7fc3ee1849ea][6] /usr/lib/libmpi.so.1(ompi\u请求\u默认\u等待+0x16d)[0x7fc3ee0d1c0d] [ 7] /usr/lib/openmpi/lib/openmpi/mca\u coll\u tuned.so(ompi\u coll\u tuned\u bcast\u intra\u generic+0x49e) [0x7fc3e486da9e][8] /usr/lib/openmpi/lib/openmpi/mca\u coll\u tuned.so(ompi\u coll\u tuned\u bcast\u intra\u二项式+0xb7) [0x7fc3e486df27][9] /usr/lib/openmpi/lib/openmpi/mca\u coll\u tuned.so(ompi\u coll\u tuned\u bcast\u intra\u dec\u fixed+0xcc) [0x7fc3e486573c][10] /usr/lib/openmpi/lib/openmpi/mca\u coll\u sync.so(mca\u coll\u sync\u bcast+0x64) [0x7fc3e4a7d6a4][11]/usr/lib/libmpi.so.1(MPI_Bcast+0x13d) [0x7fc3ee0df78d][12]。/matMul()[0x4011a9][13]。/matMul()[0x401458] [14] /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6(libc_start_main+0xf5) [0x7fc3edab7ec5][15]。/matMul()[0x400b49] 错误消息结束[0]/lib/x86_64-linux-gnu/libpthread.so.0(+0x10340)[0x7fa4a1fe5340][1] /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6(+0x981c0)[0x7fa4a1ca81c0][2] /usr/lib/libmpi.so.1(蛋白石转换器解包+0x105)[0x7fa4a22f28d5][ 3] /usr/lib/openmpi/lib/openmpi/mca\u pml\u ob1.so(mca\u pml\u ob1\u recv\u frag\u callback\u match+0x460) [0x7fa49a701630][4] /usr/lib/openmpi/lib/openmpi/mca_btl_sm.so(mca_btl_sm_component_progress+0x487) [0x7fa4998a4137][5]/usr/lib/libmpi.so.1(蛋白石进度+0x5a) [0x7fa4a22fe9ea][6] /usr/lib/libmpi.so.1(ompi\u请求\u默认\u等待+0x16d)[0x7fa4a224bc0d] [ 7] /usr/lib/openmpi/lib/openmpi/mca\u coll\u tuned.so(ompi\u coll\u tuned\u bcast\u intra\u generic+0x4e0) [0x7fa4989e7ae0][8] /usr/lib/openmpi/lib/openmpi/mca\u coll\u tuned.so(ompi\u coll\u tuned\u bcast\u intra\u二项式+0xb7) [0x7fa4989e7f27][9] /usr/lib/openmpi/lib/openmpi/mca\u coll\u tuned.so(ompi\u coll\u tuned\u bcast\u intra\u dec\u fixed+0xcc) [0x7fa4989df73c][10] /usr/lib/openmpi/lib/openmpi/mca\u coll\u sync.so(mca\u coll\u sync\u bcast+0x64) [0x7fa498bf76a4][11]/usr/lib/libmpi.so.1(MPI_Bcast+0x13d) [0x7fa4a225978d][12]。/matMul()[0x4011a9][13]。/matMul()[0x401458] [14] /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6(libc_start_main+0xf5) [0x7fa4a1c31ec5][15]。/matMul()[0x400b49] 错误消息结束* --------------------------------------------------------------------------mpirun注意到,节点上的进程级别为2,PID为12466 rtidev5.etf.bg.ac.rs在信号11(分段故障)时退出。 --------------------------------------------------------------------------共有2个进程被杀死(有些可能是在清理过程中被mpirun杀死的)


我已经弄明白了。所有进程(不仅仅是主进程)都需要首先分配内存

因此,丢失的行是

void matMulMPI(long N, double *a, double *b, double *c) {
    ...

    MPI_Bcast(&N, 1, MPI_LONG, MASTER, MPI_COMM_WORLD);

    b = (double *) malloc(N * N * sizeof(double));

    MPI_Bcast(b, N*N, MPI_DOUBLE, MASTER, MPI_COMM_WORLD);

    ...
}

我已经弄明白了。所有进程(不仅仅是主进程)都需要首先分配内存

因此,丢失的行是

void matMulMPI(long N, double *a, double *b, double *c) {
    ...

    MPI_Bcast(&N, 1, MPI_LONG, MASTER, MPI_COMM_WORLD);

    b = (double *) malloc(N * N * sizeof(double));

    MPI_Bcast(b, N*N, MPI_DOUBLE, MASTER, MPI_COMM_WORLD);

    ...
}

为了澄清为什么会出现这种情况:广播意味着广播后的每个进程都将在
MPI\u Bcast
的第一个参数中存储数据。在主进程上,它是发送缓冲区,但在其他进程上,它是接收缓冲区。无论如何,如果在调用
MPI\u Bcast
之前没有在每个进程上分配数据,那么您将尝试将数据存储在未分配的缓冲区中。这只是为了澄清为什么会出现这种情况:广播意味着广播后的每个进程都将在
MPI\u Bcast
的第一个参数中存储数据。在主进程上,它是发送缓冲区,但在其他进程上,它是接收缓冲区。无论如何,如果在调用
MPI\u Bcast
之前未在每个进程上分配数据,则将尝试将数据存储在未分配的缓冲区中。