Python Can'；t将NumPy数组导出到R数据集

我在尝试将NumPy数组转换为R数据集时遇到了一些困难。我有一张灰度为2362x2163的2D图像。我必须输入每个像素的灰度值来做一些统计分析。首先，这是我为流程导入的内容：

导入cv2
将numpy作为np导入
从skimage导入img\u as\u ubyte
从浏览导入数据
从rpy2.robjects导入r
从rpy2.robject导入pandas2ri
从导入数据帧
pandas2ri.activate（）

首先，我使用cv2作为NumPy数组导入图像，以防万一，我将数组转换为0到255（256灰度）之间的值

xchest=cv2.imread（“/home/user/xchest.tif”，cv2.imread\u灰度）
xchestsk=img\u as\u ubyte（xchest）

输出：

type(xchestsk)

是:

我需要一个简单的数据集上的所有像素信息，我可以在RStudio上使用和分析。我试过：

np.save("/home/user/xchest.npy", xchestsk)

xchest\u R=数据帧（xchestsk）
xchest_R=R.data（'xchestsk'）
r、 分配（“测试”，最大值）
r（“save（test，file='/home/user/xchest.gzip'，compress=TRUE）”）

但当我把它加载到R上时：

> load("/home/user/xchest.gzip")

我刚刚得到一个值：

test>“xchestsk”

就像我刚导入了一个字符串

我试过：

np.save("/home/user/xchest.npy", xchestsk)

但当我尝试在R上导入时，使用：

> library(RcppCNPy)
> xchest_R <- npyLoad("/home/user/xchest.npy", "integer")

但当我将其导入R时：

> xchest_data = read.csv(file="/home/eera5607/xchest.csv", header=FALSE, sep=",")

我不能做简单的统计分析，比如：

> mean(xchest_data)

因为我得到这个警告：

> argument is not numeric or logical: returning NA

我尝试将数据转换为一个变量和5000000+个点，使用：

xchest_list=xchestsk.tolist（）
xchest_ov=[]
对于xchest_列表中的列表：
xchest_ov+=列表

然后我将

xchest_ov

列表转换为CSV，但在RStudio中得到了相同的警告

---

我需要的是导入所有这些值，如果可能的话，保持矩阵结构（但这不是必需的，至少导入像素值作为常规R数据集），我可以对其应用一些统计分析。我知道我可以直接在Python上进行一些分析，但我希望这些数据可以在RStudio上进行。我对这方面的知识很少。我是一名放射科医生，这是我第一次与R合作。

不熟悉

RcppCNPy

，但csv方法应该可以工作。当您调用

str（xchest_data）

时，该方法会发生什么？我不希望

mean

直接在数据帧上工作，因为R

mean

没有数据帧或矩阵的方法，它大多只接受向量输入。你仍然可以做其他的统计分析，但如果你有具体的问题，可以问那里。为了澄清，R中的data.frames类似于pandas DataFrames，矩阵和数组更类似于NumPy数组。@CalumYou谢谢，

str（xchest_data）

的输出是：

'data.frame'：2163 obs。2362个变量中：$V1:num 8 8 8 13 23 36 38 34…$V2:num 8 8 10 8 15 20 23 36 34…$V3:num 8 8 11 8 15 21 24 36 35…$V4:num 8 8 11 8 17 21 27 37 35…$V5:num 8 8 11 8 16 21 26 40 39…$V6:num 8 8 12 8 14 20 26 39 35…$V7:num 8 8 12 8 17 18 31 41 42…$V8:num 8 8 12 8 17 23 32 40 39…$V9:num 8 8 12 8 14 23 29 39…$V10:num 8 8 8 12 8 16 23 25 37 36…

并一直持续到被截断。确定后，看起来数据已成功读取到数据帧中。还有问题吗？@CalumYou是的，如果我有2362个变量（图像高度），我如何处理所有数据点作为一个整体？我希望有一组干净的数据点，我甚至可以应用简单的统计分析。例如，可以执行

x=xchest\u data$V99

和do

mean（x）

，但在这一点上，我不需要这样做，因为这只是图像的一行。有没有办法执行类似

x=xchest\u data$V1-V99

的操作作为示例？

> mean(xchest_data)

> argument is not numeric or logical: returning NA