Python 加载NCBITaxa崩溃

我在非常强大的服务器上使用ete2模块已经有一段时间了。 一切都很好，直到它开始运行得非常慢（每分钟一个

get\u taxid\u translator（）

函数），现在我甚至无法通过

ncbi=NCBITaxa（）

分配。 我已经卸载并重新安装了anaconda2，尝试更新到ete3，在我们的“开发服务器”上一切正常，但仍然无法通过正常服务器上任何软件中的

ncbi=NCBITaxa（）

行。即使下面的脚本也无法完成

    #!/usr/bin/env python
    from ete3 import NCBITaxa

    ncbi = NCBITaxa()

    print "Finished"

这发生在其他人身上了吗？我需要降级任何依赖项吗？这可能是权限问题吗？ 当我运行基本脚本时，ctrl+c或ctrl+z将转义脚本，我必须使用

kill-9

来终止脚本。如果我等待太久，进程将进入不间断睡眠

提前谢谢大家,， 亚历克西斯

Python 2.7.12:：Anaconda自定义（64位）

---

gcc（gcc）5.4.0

stackoverflow社区不太可能回答“还有其他人遇到过这个问题吗”式的问题，尤其是因为您指出代码在您的开发服务器上工作。至少，您应该提供一个最小的可复制示例，以便其他人可以尝试复制您的问题：即一组命令，从加载ete模块开始，到调用

NCBITaxa

结束。关于您的问题的一些想法：您检查过python、库和依赖项版本在服务器之间是否相同吗？NCBITaxa是否尝试连接到外部数据库？如果是这样，则可能是服务器配置/连接问题。NCBITaxa（）连接到sqlite3数据库。如果anaconda基本目录位于网络文件系统上，这可能是一个I/O问题。stackoverflow社区不太可能回答“是否有其他人遇到此问题”式的问题，尤其是因为您指出代码在您的开发服务器上工作。至少，您应该提供一个最小的可复制示例，以便其他人可以尝试复制您的问题：即一组命令，从加载ete模块开始，到调用

NCBITaxa

结束。关于您的问题的一些想法：您检查过python、库和依赖项版本在服务器之间是否相同吗？NCBITaxa是否尝试连接到外部数据库？如果是这样，则可能是服务器配置/连接问题。NCBITaxa（）连接到sqlite3数据库。如果anaconda基本目录位于网络文件系统上，这可能是一个I/O问题。