用python绘制ROC曲线进行多分类

用python绘制ROC曲线进行多分类,python,numpy,scikit-learn,roc,Python,Numpy,Scikit Learn,Roc,从这里跟进: 我想为我46个班的每个班画ROC曲线。我有300个测试样本,我已经运行了我的分类器来进行预测 y_test是真正的类,而y_pred是我的分类器预测的 这是我的密码: from sklearn.metrics import confusion_matrix, roc_curve, auc from sklearn.preprocessing import label_binarize import numpy as np y_test_bi = l

从这里跟进:

我想为我46个班的每个班画ROC曲线。我有300个测试样本,我已经运行了我的分类器来进行预测

y_test
是真正的类,而
y_pred
是我的分类器预测的

这是我的密码:

    from sklearn.metrics import confusion_matrix, roc_curve, auc
    from sklearn.preprocessing import label_binarize
    import numpy as np

    y_test_bi = label_binarize(y_test, classes=[0,1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18, 19,20,21,2,23,24,25,26,27,28,29,30,31,32,33,34,35,36,37,38,3,40,41,42,43,44,45])
    y_pred_bi = label_binarize(y_pred, classes=[0,1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18, 19,20,21,2,23,24,25,26,27,28,29,30,31,32,33,34,35,36,37,38,3,40,41,42,43,44,45])
    # Compute ROC curve and ROC area for each class
    fpr = dict()
    tpr = dict()
    roc_auc = dict()
    for i in range(2):
        fpr[i], tpr[i], _ = roc_curve(y_test_bi, y_pred_bi)
        roc_auc[i] = auc(fpr[i], tpr[i])
但是,现在我得到了以下错误:

Traceback (most recent call last):
  File "C:\Users\app\Documents\Python Scripts\gbc_classifier_test.py", line 152, in <module>
    fpr[i], tpr[i], _ = roc_curve(y_test_bi, y_pred_bi)
  File "C:\Users\app\Anaconda\lib\site-packages\sklearn\metrics\metrics.py", line 672, in roc_curve
    fps, tps, thresholds = _binary_clf_curve(y_true, y_score, pos_label)
  File "C:\Users\app\Anaconda\lib\site-packages\sklearn\metrics\metrics.py", line 505, in _binary_clf_curve
    y_true = column_or_1d(y_true)
  File "C:\Users\app\Anaconda\lib\site-packages\sklearn\utils\validation.py", line 265, in column_or_1d
    raise ValueError("bad input shape {0}".format(shape))
ValueError: bad input shape (300L, 46L)
回溯(最近一次呼叫最后一次):
文件“C:\Users\app\Documents\Python Scripts\gbc\u classifier\u test.py”,第152行,在
fpr[i]、tpr[i]、u=roc_曲线(y_检验,y_预测)
文件“C:\Users\app\Anaconda\lib\site packages\sklearn\metrics\metrics.py”,第672行,在roc\U曲线中
fps、tps、阈值=\二进制\ clf\曲线(y\真、y\分数、位置标签)
文件“C:\Users\app\Anaconda\lib\site packages\sklearn\metrics\metrics.py”,第505行,在二进制clf曲线中
y_真=列或1d(y_真)
文件“C:\Users\app\Anaconda\lib\site packages\sklearn\utils\validation.py”,第265行,在列\u或\u 1d中
raise VALUERROR(“错误的输入形状{0}”。格式(形状))
ValueError:输入形状错误(300L、46L)

roc\u曲线
采用形状参数
[n\u样本]
(),并且您的输入(无论是
y\u测试/u bi
还是
y\u预测/u bi
)都是形状
(300,46)
。注意第一点

我认为问题在于
y\u pred\u bi
是一个概率数组,通过调用
clf.predict\u proba(X)
(请确认)。由于您的分类器在所有46个类上都进行了训练,因此它为每个数据点输出46维向量,
label\u binarize
对此无能为力

我知道两种解决方法:

  • clf.fit()
    之前调用
    label\u binarize
    训练46个binary分类器,然后计算ROC曲线
  • 对300×46输出数组的每一列进行切片,并将其作为第二个参数传递给
    roc\u曲线
    。这是我的首选方法,我假设
    y\u pred\u bi
    包含概率

  • 使用
    标签\u二值化

    import matplotlib.pyplot as plt
    from sklearn import svm, datasets
    from sklearn.model_selection import train_test_split
    from sklearn.preprocessing import label_binarize
    from sklearn.metrics import roc_curve, auc
    from sklearn.multiclass import OneVsRestClassifier
    
    iris = datasets.load_iris()
    X = iris.data
    y = iris.target
    
    # Binarize the output
    y = label_binarize(y, classes=[0, 1, 2])
    n_classes = y.shape[1]
    
    X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size=.5, random_state=0)
    classifier = OneVsRestClassifier(svm.SVC(kernel='linear', probability=True,
                                     random_state=0))
    y_score = classifier.fit(X_train, y_train).decision_function(X_test)
    
    fpr = dict()
    tpr = dict()
    roc_auc = dict()
    for i in range(n_classes):
        fpr[i], tpr[i], _ = roc_curve(y_test[:, i], y_score[:, i])
        roc_auc[i] = auc(fpr[i], tpr[i])
    colors = cycle(['blue', 'red', 'green'])
    for i, color in zip(range(n_classes), colors):
        plt.plot(fpr[i], tpr[i], color=color, lw=lw,
                 label='ROC curve of class {0} (area = {1:0.2f})'
                 ''.format(i, roc_auc[i]))
    
    plt.plot([0, 1], [0, 1], 'k--', lw=lw)
    plt.xlim([-0.05, 1.0])
    plt.ylim([0.0, 1.05])
    plt.xlabel('False Positive Rate')
    plt.ylabel('True Positive Rate')
    plt.title('Receiver operating characteristic for multi-class data')
    plt.legend(loc="lower right")
    plt.show()
    

    感谢您在n_样品上的ip!我忘了做:
    fpr[I]、tpr[I]、roc\u曲线(y\u test[:,I]、y\u score[:,I])
    而是直接通过
    y\u test
    y\u score
    roc\u曲线
    函数。我也有同样的问题。我有y_测试作为形状(648,)和y_probs作为(648,2)。我得到以下错误:ValueError:bad input shape(648,2)如何使y_probs成为一维向量?