从makefile激活Anaconda Python环境

我想使用makefile来构建我的项目环境，使用makefile和，因此我应该能够克隆repo并简单地运行

makemyproject

myproject: build

build:
  @printf "\nBuilding Python Environment\n"
  @conda env create --quiet --force --file environment.yml
  @source /home/vagrant/miniconda/bin/activate myproject

但是，如果我尝试这样做，我会得到以下错误

make:source:未找到命令

make:**[来源]错误127

我已经搜索了一个解决方案，但是[this question/answer（）表明我不能在makefile中使用

source

然而，他提出了一个解决方案（并获得了几票赞成票），但这对我也不起作用

（\
source/home/vagrant/miniconda/bin/activate myproject\

)

/bin/sh:2:来源：未找到

make:**[来源]错误127

我还尝试将

source activate

步骤移动到一个单独的bash脚本中，并从makefile执行该脚本。这不起作用，我假设是出于类似的原因，即我正在shell中运行

source

---

我应该补充一点，如果我从终端运行

source activate myproject

，它会正常工作。

我也有同样的问题。基本上唯一的解决方案是9000。我有一个安装shell脚本，在其中我设置了conda环境（source activate python2），然后调用make命令。我尝试从Makefile内部设置环境，但没有成功

我的makefile中有一行：

installpy :
   ./setuppython2.sh && python setup.py install

错误消息为：

make
./setuppython2.sh && python setup.py install
running install
error: can't create or remove files in install directory

The following error occurred while trying to add or remove files in the
installation directory:

    [Errno 13] Permission denied: '/usr/lib/python2.7/site-packages/test-easy-install-29183.write-test'

基本上，我可以设置我的conda环境以使用我具有写访问权限的本地conda。但这不是make进程所选择的。我不明白为什么在我的shell脚本中使用“source”设置的环境在make进程中不可见；source命令应该更改当前shell。我只想我知道Autotools有一种使用python的方法，但是make程序在这方面可能是有限的

我当前的解决方案是一个shell脚本：

cat py2make.sh 这似乎对我很有效

类似的情况也有类似的解决方案，但似乎对我不起作用：

我修改的Makefile段：

installpy :
   ( source activate python2; python setup.py install )

调用make后出现错误消息：

make
( source activate python2; python setup.py install )
/bin/sh: line 0: source: activate: file not found
make: *** [installpy] Error 1

---

不确定我错在哪里。如果有人有更好的解决方案，请与我们分享。

我有一个类似的问题；我想从Makefile创建或更新conda环境，以确保我自己的脚本可以使用该conda环境中的python。
默认情况下，make使用sh执行命令，而sh不知道源代码（另请参见）。我只是将SHELL设置为bash，结果是（仅相关部分）：

---

希望它能帮上忙，你应该用这个，它现在对我来说很实用

report.ipynb : merged.ipynb
    ( bash -c "source ${HOME}/anaconda3/bin/activate py27; which -a python; \
        jupyter nbconvert \
        --to notebook \
        --ExecutePreprocessor.kernel_name=python2 \
        --ExecutePreprocessor.timeout=3000 \
        --execute merged.ipynb \
        --output=$< $<" )

report.ipynb:merged.ipynb
（bash-c“source${HOME}/anaconda3/bin/activate py27；它是python\
朱皮特·恩康维特\
--记\
--executeProcessor.kernel_name=python2\
--ExecuteProcessor.timeout=3000\
--执行merged.ipynb\
--output=$<$读取
/home/vagrant/miniconda/bin/activate
的内容。请注意，
source
是一个内置的shell，不是可调用的可执行文件，它在当前shell的上下文中执行文件的语句。由于
make
运行不同的shell副本，因此您无法在当前shell中从中激活virtualenvshell，就像你不能从makefile中更改当前shell的目录一样。因此，基本上我无法用makefile实现这一点？你可以克隆一个repo，激活shell中的一个环境，并在调用shell时运行一个makefile步骤（可能是另一个makefile）。例如，
/bin/sh-c“源路径/到/激活；使我成为三明治"
@PhilipO'Brien看看你最后选择了什么方法真的很有趣。我也面临着同样的限制。非常感谢你的提示-将我的shell设置为Bash shell是让
源代码
命令工作的诀窍！似乎还需要使用
&
才能让命令在我的环境中运行这真的很有帮助
SHELL=/bin/bash
CONDAROOT = /my/path/to/miniconda2
.
.
install: sometarget
        source $(CONDAROOT)/bin/activate && conda env create -p conda -f environment.yml && source deactivate

report.ipynb : merged.ipynb
    ( bash -c "source ${HOME}/anaconda3/bin/activate py27; which -a python; \
        jupyter nbconvert \
        --to notebook \
        --ExecutePreprocessor.kernel_name=python2 \
        --ExecutePreprocessor.timeout=3000 \
        --execute merged.ipynb \
        --output=$< $<" )