Python：使用h5py和NumPy从MATLAB.mat文件中读取str

我很难将MATLAB.mat文件中的'str'变量'Et'（Endtime）和'St'（Starttime）加载到Python中

我想要与MATLAB中相同的输出。相反，我在试图解决这个问题时遇到了一些问题。请参见下面的Python代码和输出

# Import numpy and h5py to load in .mat files
import numpy as np
import h5py 

# Load in Matlab ('-v7.3') data
fname = 'directory/file.mat'
f = h5py.File(fname,'r') 

# create dictionary for data
data= {"average":np.array(f.get('average')),"median":np.array(f.get('median')), \
             "stdev":np.array(f.get('stdev')),"P10":np.array(f.get('p10')), \
             "P90":np.array(f.get('p90')),"St":np.str(f.get('stime')), \
             "Et":np.str(f.get('etime'))}
# All other variables are arrays

print(data["Et"])

输出：

<HDF5 dataset "etime": shape (1, 6), type "<u4">

我想让python中的字符串与MATLAB中的字符串相等。 换句话说，我想要打印（data[“Et”]）='01011212000000'，这是日期和时间

我怎样才能解决这个问题

MATLAB中的数据示例：

---

当我需要加载

.mat

时，我使用

scipy

，它工作正常。 试试这个：

import scipy.io
mat = scipy.io.loadmat('fileName.mat')

我想它会起作用的。 祝你好运。

八度音阶

>> x = 1:10;
>> y = reshape(1:12, 3,4);
>> et = '0101121200000';
>> xt = 'a string';
>> save -hdf5 testh5.mat x y et xt

在numpy会议中：

In [130]: f = h5py.File('testh5.mat','r')
In [131]: list(f.keys())
Out[131]: ['et', 'x', 'xt', 'y']
In [132]: list(f['y'].keys())
Out[132]: ['type', 'value']
In [133]: f['x/type'].value
Out[133]: b'range'
In [134]: f['y/type'].value
Out[134]: b'matrix'
In [135]: f['y/value'].value
Out[135]: 
array([[ 1.,  2.,  3.],
       [ 4.,  5.,  6.],
       [ 7.,  8.,  9.],
       [10., 11., 12.]])
In [136]: f['et/type'].value
Out[136]: b'sq_string'
In [137]: f['et/value'].value
Out[137]: 
array([[48],
       [49],
       [48],
       [49],
       [49],
       [50],
       [49],
       [50],
       [48],
       [48],
       [48],
       [48],
       [48]], dtype=int8)
In [138]: f['et/value'].value.ravel().view('S13')
Out[138]: array([b'0101121200000'], dtype='|S13')
In [139]: f['xt/value'].value.ravel().view('S8')
Out[139]: array([b'a string'], dtype='|S8')
In [140]: f.close()

====

字节

也适用于我的文件

In [220]: bytes(f['xt/value'].value)
Out[220]: b'a string'
In [221]: bytes(f['et/value'].value)
Out[221]: b'0101121200000'

---

如果您不介意

file.mat

中存储的

etime

和

stime

的变量类型，并且您可以将它们存储为type

char

而不是

string

，您可以通过以下方式在Python中读取它们：

字节（f.get（您的变量）.value）.decode（'utf-8'）

。就你而言：

data = {
    "average": np.array(f.get('average')),
    "median": np.array(f.get('median')),
    "stdev": np.array(f.get('stdev')),
    "P10": np.array(f.get('p10')),
    "P90": np.array(f.get('p90')),
    "St": bytes(f.get('stime')[:]).decode('utf-8'),
    "Et": bytes(f.get('etime')[:]).decode('utf-8')
}

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我确信还有一种方法可以读取

字符串

类型，但这可能是最简单的解决方案。

听起来好像OP用较新的hdf5模式保存了.mat，而不是兼容的

loadmat

模式。执行此过程时，我看不到任何字符串变量。输出：

dict_键（['''''''''''''''''''''''''''''''''''''''''u版本'''''''''.'全局'''.'平均'，'stdev'，'median'.'P90'，'P10'，'None'.''''.'''''''.'''''.'''''''.'''''''''.'函数'.'工作区'.'.'.'.'.'无Et或St.'注：不必担心NAN-它们应该是这样的。至少在八度'hdf5'文件中，
f[/code>f。把两者分开阅读是个好主意。对于字符串，
type
是
b'sq_string'
，
value
是一个“int8”数据类型的（n，1）数组。我认为，这可以通过testring转换为Python
。在加载
hdf5
mat文件的过程中，出现了一些这样的问题，尽管我不记得是否有人看过字符串，
f.get（'etime'）
？它是一个组还是一个数据集？如果是一个组，它是否有任何键？请尝试
np.array（f.get（'etime'））
。将其作为数组加载；之后我们可能可以“解码”它，就像我在[138]中的
中所做的那样。让我们细化
np.array（f.get（'etime'），dtype='这对我不起作用。当使用
list（f['average'].keys（））时，
我得到以下错误：AttributeError:'Dataset'对象没有属性'keys'。好的，在我的版本中，
f['average']
是一个包含2个数据集的组。显然在您的
f['average']
是数据集本身。我没有你的文件，所以无法亲自查看。“average”是一个9 x 365的矩阵，其中大部分是NaN，到处都有一些浮点数。仔细研究，我发现MATLAB v7.3和Octave的hdf5之间有更大的差异。如果没有示例文件，我就无能为力。@hpualj我在MATLAB.I c中添加了数据的图像我们找不到附加.mat文件的方法谢谢@machnic！这非常有效。我现在已经将字符串从.mat文件加载到python中。