R(封装过热)-向树状图添加颜色(或矩形)
最少的示例和包文档(): 我想实现两件事:R(封装过热)-向树状图添加颜色(或矩形),r,heatmap,dendrogram,grob,ggdendro,R,Heatmap,Dendrogram,Grob,Ggdendro,最少的示例和包文档(): 我想实现两件事: 根据簇的颜色分支(我必须确定簇的k个数)或在“选定”簇的顶部添加矩形 我还希望提取相同的树状图,并将其应用于不同的数据集(具有相同的变量) 我相信树状图是使用ggdendro创建的(如果有帮助的话) 因此,这些就是我想要实现的示例:ggdendro包不支持分支颜色,通常不再支持。它被dendextend包(包括ggdend对象,它支持分支颜色、lwd和lty)取代。 您可以使用Dendestend准备您的树状图,并将它们输入到gplots的热图中
- 根据簇的颜色分支(我必须确定簇的k个数)或在“选定”簇的顶部添加矩形
- 我还希望提取相同的树状图,并将其应用于不同的数据集(具有相同的变量)
因此,这些就是我想要实现的示例:ggdendro包不支持分支颜色,通常不再支持。它被dendextend包(包括ggdend对象,它支持分支颜色、lwd和lty)取代。 您可以使用Dendestend准备您的树状图,并将它们输入到gplots的热图中。或者,您可以查看heatmaply软件包 祝你好运
library(superheat)
superheat(mtcars,
# scale the matrix columns
scale = TRUE,
left.label = "none",
# add row dendrogram
col.dendrogram = TRUE,
legend=F,
)