将R转换为宽格式,排列方式取决于列中的值
我得到了一个表格,其中包含了各种样本(“样本1”等)的数据,使用这些数据进行了几种类型的测量(a到C)。每次测量给出3个值:浓度、最大值和最小值将R转换为宽格式,排列方式取决于列中的值,r,dplyr,pivot,R,Dplyr,Pivot,我得到了一个表格,其中包含了各种样本(“样本1”等)的数据,使用这些数据进行了几种类型的测量(a到C)。每次测量给出3个值:浓度、最大值和最小值 my.sample <- c("sample1", "sample1", "sample2", "sample2", "sample3") type <- c("A", "B", "A&quo
my.sample <- c("sample1", "sample1", "sample2", "sample2", "sample3")
type <- c("A", "B", "A", "C", "C")
concentration <- c(12, 5, 7, 10, 14)
max <- c(13, 6, 7, 11, 15)
min <- c(11, 4, 6, 9, 13)
mydata <- data.frame(my.sample, type, concentration, max, min)
> mydata
my.sample type concentration max min
1 sample1 A 12 13 11
2 sample1 B 5 6 4
3 sample2 A 7 7 6
4 sample2 C 10 11 9
5 sample3 C 14 15 13
是否有方法根据条件加宽数据并在列名中包含值(此处:fromtype
)?我的真实数据集中有更多的类型,因此理想情况下,它应该是可推广的。这是可行的:
library(dplyr)
mydata %>%
pivot_wider(id_cols = my.sample, names_from = type, values_from = c(concentration, max, min), names_glue = "{type}_{.value}") %>%
select(my.sample, starts_with("A"), starts_with("B"), starts_with("C"))
这给了我们:
# A tibble: 3 x 10
my.sample A_concentration B_concentration C_concentration A_max B_max C_max A_min B_min C_min
<chr> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
1 sample1 12 5 NA 13 6 NA 11 4 NA
2 sample2 7 NA 10 7 NA 11 6 NA 9
3 sample3 NA NA 14 NA NA 15 NA NA 13
#一个tible:3 x 10
我的样本A_浓度B_浓度C_浓度A_最大B_最大C_最大A_最小B_最小C_最小
1个样本1 12 5 NA 13 6 NA 11 4 NA
2样本2 7 NA 10 7 NA 11 6 NA 9
3样本3 NA 14 NA 15 NA 13
这项工作:
library(dplyr)
mydata %>%
pivot_wider(id_cols = my.sample, names_from = type, values_from = c(concentration, max, min), names_glue = "{type}_{.value}") %>%
select(my.sample, starts_with("A"), starts_with("B"), starts_with("C"))
这给了我们:
# A tibble: 3 x 10
my.sample A_concentration B_concentration C_concentration A_max B_max C_max A_min B_min C_min
<chr> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
1 sample1 12 5 NA 13 6 NA 11 4 NA
2 sample2 7 NA 10 7 NA 11 6 NA 9
3 sample3 NA NA 14 NA NA 15 NA NA 13
#一个tible:3 x 10
我的样本A_浓度B_浓度C_浓度A_最大B_最大C_最大A_最小B_最小C_最小
1个样本1 12 5 NA 13 6 NA 11 4 NA
2样本2 7 NA 10 7 NA 11 6 NA 9
3样本3 NA 14 NA 15 NA 13
太棒了,非常感谢!如何将类型值放在列名的第一位(例如A_浓度等)?@Nereus np!更新了帖子。您可以使用names\u glue
非常好,非常感谢!如何将类型值放在列名的第一位(例如A_浓度等)?@Nereus np!更新了帖子。您可以使用名称\u胶水