根据R中的行或列的类别选择数据帧的元素

对于这4个基因中的每一个（每个基因都在列上），我需要测试其平均表达对于病情稳定和进展的患者是否相等，并存储相应的p值。有人能帮我吗？语言是R。 下面是我的数据帧的图片：

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假设这是您的数据帧：

df = data.frame(y=sample(c("progres.","stable"),100,replace=TRUE),matrix(rnorm(100*4),ncol=4))
colnames(df)[-1] = c("X1000_at","X1001_at","X1002_at","X1003_at")

如果只需要p.值，可以执行以下操作：

apply(df[,-1],2,function(i)t.test(i ~ df$y)[["p.value"]])
  X1000_at   X1001_at   X1002_at   X1003_at 
0.14861795 0.11653459 0.01820033 0.41873270 

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在上面，您遍历基因列，t.在由

y

列划分的组之间进行测试，并仅捕获p值。

假设这是您的数据帧：

df = data.frame(y=sample(c("progres.","stable"),100,replace=TRUE),matrix(rnorm(100*4),ncol=4))
colnames(df)[-1] = c("X1000_at","X1001_at","X1002_at","X1003_at")

如果只需要p.值，可以执行以下操作：

apply(df[,-1],2,function(i)t.test(i ~ df$y)[["p.value"]])
  X1000_at   X1001_at   X1002_at   X1003_at 
0.14861795 0.11653459 0.01820033 0.41873270 

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在上面，您迭代基因列，t.在由

y

列划分的组之间进行测试，并仅捕获p值。

您是否可以不使用图像？例如，如果您的data.frame被称为df，则执行dput（head（df，6））并粘贴输出？这样我们可以处理您的数据。框架您是否可以不使用图像？例如，如果您的data.frame被称为df，则执行dput（head（df，6））并粘贴输出？通过这种方式，我们可以处理您的数据。框架感谢您的帮助这正是我所需要的，但是您在给我的第二个示例中返回的数据框架的“dm”列是什么？这是方法上的差异。谢谢，但是第一个例子和第二个例子的p.value是不同的。这是正常的吗？是的，第二个是近似值，如果你有很多列要迭代的话。对不起，我没提那件事。如果您只有4列并且想要一个精确的p值，请使用apply（…），因此，如果我有相同的数据帧和10000列，那么恢复p_值的方法是什么？（代码是什么）感谢您的帮助这是我所需要的，但是您在给我的第二个示例中返回的数据帧的“dm”列是什么？这是方法上的差异。谢谢，但是第一个例子和第二个例子的p.value是不同的。这是正常的吗？是的，第二个是近似值，如果你有很多列要迭代的话。对不起，我没提那件事。如果您只有4列并且想要一个精确的p值，请使用apply（…），因此，如果我有相同的数据帧和10000列，那么恢复p_值的方法是什么？（代码是什么）