Warning: file_get_contents(/data/phpspider/zhask/data//catemap/4/r/66.json): failed to open stream: No such file or directory in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 167

Warning: Invalid argument supplied for foreach() in /data/phpspider/zhask/libs/tag.function.php on line 1116

Notice: Undefined index: in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 180

Warning: array_chunk() expects parameter 1 to be array, null given in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 181
通过R3.0.2中的RMySQL包连接到数据库_R_Data Analysis_Rmysql - Fatal编程技术网

通过R3.0.2中的RMySQL包连接到数据库

通过R3.0.2中的RMySQL包连接到数据库,r,data-analysis,rmysql,R,Data Analysis,Rmysql,我正在尝试连接到ucsc基因组服务器,然后尝试在其中选择一个数据库hg19 我已经知道的方法(效果非常好): hg19命令需要一个db参数。它为连接设置默认模式,但是,在dbSendQuery命令中没有必须使用默认模式的规则。例如,如果您连接到 hg19 <- dbConnect(MySQL(),user="genome",db="hg19",host="genome-mysql.cse.ucsc.edu") ucscDb <- dbConnect(MySQL(),user = "

我正在尝试连接到ucsc基因组服务器,然后尝试在其中选择一个数据库hg19

我已经知道的方法(效果非常好):


hg19命令需要一个db参数。它为连接设置默认模式,但是,在
dbSendQuery
命令中没有必须使用默认模式的规则。例如,如果您连接到

hg19 <- dbConnect(MySQL(),user="genome",db="hg19",host="genome-mysql.cse.ucsc.edu")
ucscDb <- dbConnect(MySQL(),user = "genome",host = "genome-mysql.cse.ucsc.edu")
hg19 <- dbConnect(MySQL(),user="genome",db="hg19",host="genome-mysql.cse.ucsc.edu")
query = dbSendQuery(hg19, "SELECT * FROM hg18.sometable);
hg18Data = fetch(query, n=-1);