通过R3.0.2中的RMySQL包连接到数据库
我正在尝试连接到ucsc基因组服务器,然后尝试在其中选择一个数据库hg19 我已经知道的方法(效果非常好):通过R3.0.2中的RMySQL包连接到数据库,r,data-analysis,rmysql,R,Data Analysis,Rmysql,我正在尝试连接到ucsc基因组服务器,然后尝试在其中选择一个数据库hg19 我已经知道的方法(效果非常好): hg19命令需要一个db参数。它为连接设置默认模式,但是,在dbSendQuery命令中没有必须使用默认模式的规则。例如,如果您连接到 hg19 <- dbConnect(MySQL(),user="genome",db="hg19",host="genome-mysql.cse.ucsc.edu") ucscDb <- dbConnect(MySQL(),user = "
hg19命令需要一个db参数。它为连接设置默认模式,但是,在dbSendQuery
命令中没有必须使用默认模式的规则。例如,如果您连接到
hg19 <- dbConnect(MySQL(),user="genome",db="hg19",host="genome-mysql.cse.ucsc.edu")
ucscDb <- dbConnect(MySQL(),user = "genome",host = "genome-mysql.cse.ucsc.edu")
hg19 <- dbConnect(MySQL(),user="genome",db="hg19",host="genome-mysql.cse.ucsc.edu")
query = dbSendQuery(hg19, "SELECT * FROM hg18.sometable);
hg18Data = fetch(query, n=-1);