R 用gsub提取字符串部分

我对R很陌生，现在正在使用由我和我的主管完成的脚本。 不幸的是，我无法将gsub（）的一个实例重新用于示例的名称。 以前的版本是这样的（在整个df中前后各不相同）：

并被拆开使用

cell.counts$EH_ID <- gsub("\\d+: (Anterior|Posterior) LN_(\\d{2})_\\d{3}.fcs", "LM02\\2", cell.counts$Sample)
cell.counts$Position <- gsub("\\d+: (Anterior|Posterior) LN_(\\d{2})_\\d{3}.fcs", "\\1", cell.counts$Sample)

在整个df中，mLN和SPLEN各不相同，我尝试调整的代码不再起作用：

cells$Mouse_ID <- gsub("\\d+: (mLN|spleen)(_\\d{2})_\\d{3}_\\.fcs", "AA_0\\2", cells$Sample)
cells$tissue <- gsub("\\d+: (mLN|spleen)_(\\d{3})_\\d{3}.fcs", "\\1", cells$Sample)

---

cells$Mouse\u ID您希望鼠标ID行的第二个捕获组中正好有2位数字，并且文件名前有一个尾随下划线

同样，在第二个正则表达式中，您没有转义
，因为未转义的
将匹配任何字符，但应为
\\.
，如下所示

# > str <- "1: mLN_681_030.fcs"
# > gsub(str, pattern="\\d+: (mLN|spleen)(_\\d{3})_\\d{3}\\.fcs", replacement = "AA_0\\2")
# [1] "AA_0_681"
# > gsub(str, pattern = "\\d+: (mLN|spleen)_(\\d{3})_\\d{3}\\.fcs", replacement = "\\1")
# [1] "mLN"

str gsub（str，pattern=“\\d+：（mLN | splene）（\\d{3}）\\d{3}\\\\.fcs”，replacement=“AA_0\\2”）
#[1]“AA_0_681”
#>gsub（str，pattern=“\\d+：（mLN | splene）\\\\.fcs”，replacement=“\\1”）
#[1]“百万富翁”

gsub使用正则表达式。这个站点（）是一个很好的参考。这个（）有一个很好的交互测试工具。谢谢！这起了作用，看起来几乎是应该的。但是如何去掉“0”之后的“uu”？我应该指定结果应该是“AA_XXXX”，将下划线移出捕获组

”\\d+：（mLN | splene）（{ud{3}）\\\\.fcs“

->

”\\d+：（mLN | splene）\\\d（\\d{3}\\\\\.fcs”

定义正则表达式捕获的内容，并在这种情况下可在编号的输出中访问

“\\2”

cells$Mouse_ID <- gsub("\\d+: (mLN|spleen)(_\\d{2})_\\d{3}_\\.fcs", "AA_0\\2", cells$Sample)
cells$tissue <- gsub("\\d+: (mLN|spleen)_(\\d{3})_\\d{3}.fcs", "\\1", cells$Sample)

# > str <- "1: mLN_681_030.fcs"
# > gsub(str, pattern="\\d+: (mLN|spleen)(_\\d{3})_\\d{3}\\.fcs", replacement = "AA_0\\2")
# [1] "AA_0_681"
# > gsub(str, pattern = "\\d+: (mLN|spleen)_(\\d{3})_\\d{3}\\.fcs", replacement = "\\1")
# [1] "mLN"