Packrat图书馆可以'；拆开包装后，不得进行快照

首先，我意识到我的痛苦完全是自己造成的

在将某些包移动到

external.packages

选项时，我首先使用

remove.packages（）

从packrat卸载了它们，而不是按照包作者的建议

packrat:：clean（）

项目中的代码工作正常（因为在会话中正确加载了外部包），但从那时起就无法更新库。如果尝试执行快照，则会出现以下错误

Error: Unable to retrieve package records for the following packages:
- "knitr", "rmarkdown"

我试着重新安装软件包，packrat冲我吼了一声

Warning in install.packages :
  packages ‘knitr’, ‘rmarkdown’ are in use and will not be installed

因此，我尝试使用

clean（c（'knitr'，'rmarkdown'），force=TRUE）

调用适当的函数，但在收到此消息时仍然没有出路

Error in find.package(pkgs, lib) : 
  there are no packages called ‘knitr’, ‘rmarkdown’

我试图检查packrat库中是否实际存在这些包，它们确实存在

> .libPaths()
[1] "C:/Users/Admn/Documents/.../cct/packrat/lib/x86_64-w64-mingw32/3.5.1"    
[2] "C:/Users/Admn/Documents/.../cct/packrat/lib-ext/x86_64-w64-mingw32/3.5.1"
[3] "C:/Users/Admn/Documents/.../cct/packrat/lib-R/x86_64-w64-mingw32/3.5.1"  

> c('knitr', 'rmarkdown') %in% .packages(all.available = TRUE)
[1] TRUE TRUE
> c('knitr', 'rmarkdown') %in% 
      list.dirs(.libPaths()[2], full.names = FALSE, recursive = FALSE)
[1] TRUE TRUE

我很想用

unlink（）

从库目录中手动拉出这两个文件夹，但我怀疑最终可能会产生更多问题

如果可以避免的话，我不想重新安装整个packrat库——所有的500MB——因为我可以访问速度非常慢、价格昂贵的互联网。有人知道如何走出这一困境吗？

似乎是同一个问题。您可能有一个依赖于

knitr

和/或

rmarkdown

的包。在使用外部包的情况下，似乎没有解决此问题的方法

我试着重新安装软件包，packrat冲我吼了一声

您是在使用packrat

packrat:：on（）的同一个会话中完成的吗？在这种情况下，您的
.libPaths（）
已更改，并且

。。。进入packrat模式时从用户库加载

在更改
.libPaths（）
之前。例如，我在我的一个项目中得到了以下信息

packrat:：get_opts（“external.packages”）
#R[1]“BH”
“BH”%in%.packages（all.available=TRUE）
#R[1]正确
“BH”%in%list.dirs（.libpath（）[1]），请注意
full.names=FALSE，recursive=FALSE）
#R[1]错误
.libPaths（）
#R[1]“/My/Path/To/My project/packrat/lib/x86_64-w64-mingw32/3.5.1”
#R[2]“/My/Path/To/My project/packrat/lib ext/x86_64-w64-mingw32/3.5.1”
#R[3]“/My/Path/To/My project/packrat/lib-R/x86_64-w64-mingw32/3.5.1”
packrat：：off（）
.libPaths（）
#R[1]“/My/Path/To/R/win library/3.5”
#R[2]“C:/Program Files/R/R-3.5.1/库”
“BH”%in%list.dirs（.libpath（）[1]），请注意
full.names=FALSE，recursive=FALSE）
#R[1]正确

在这里，我关闭packrat返回我的用户库，在那里我可以通过
remove.packages
卸载
BH
，从
help（“remove packages”）

lib
一个字符向量，给出要从中删除包的库目录。如果缺少，则默认为
.libpath（）
中的第一个元素

由于参数
lib.loc
的默认值为

packrat:::libDir(NULL)
#R [1] "/My/Path/To/My-project/packrat/lib/x86_64-w64-mingw32/3.5.1"

更新
这个问题可以通过Github问题中所示的
expert.dependencies
参数
packrat:：snapshot
来解决。
我最近对这个项目有一些用处，因此我将重新讨论它，并牢记您的贡献，让您知道它是如何进行的。谢谢