更改R中的列标题,交替使用空格和名称(适用于genalex格式)
我有一个名为genalex的数据框,因为我试图将我的基因数据转换成通用的“genalex”格式。我刚刚在R中使用了更改R中的列标题,交替使用空格和名称(适用于genalex格式),r,replace,dataframe,names,strsplit,R,Replace,Dataframe,Names,Strsplit,我有一个名为genalex的数据框,因为我试图将我的基因数据转换成通用的“genalex”格式。我刚刚在R中使用了strsplit函数来拆分列,现在我有了这个: > genalex[1:5,1:10] Ind V1 V2 V3 V4 V5 V6 V7 V8 V9 1 100 A A C C N N C C N 2 101 A A C C N N N N N 3 10 A A C C N N C C N 4 11 A A N
strsplit
函数来拆分列,现在我有了这个:
> genalex[1:5,1:10]
Ind V1 V2 V3 V4 V5 V6 V7 V8 V9
1 100 A A C C N N C C N
2 101 A A C C N N N N N
3 10 A A C C N N C C N
4 11 A A N N N N C C N
5 12 N N N N N N C C G
这个数据帧实际上有330行和32068列。我想用新名称替换其他每一列(V1、V3、V5、V7、V9等)的名称。我还想删除所有其他列名(V2、V4、V6、V8等)
对于新列名,我希望在拆分列之前使用旧数据框中的列名。我将调用旧的数据帧表
。此数据框有16034列,因为它不包括空格:
table[1:5,1:5]
X X446043 X539052 X614054 X683054
1 100 A C N C
2 101 A C N N
3 10 A C N C
4 11 A N N C
5 12 N N N C
因此,使用表中的旧列名
,然后在每列之间添加一个空格,我最终希望我的数据帧看起来像这样,适用于所有32068列:
> genalex[1:5,1:8]
Ind X446043 X539052 X614054 X683054
1 100 A A C C N N C
2 101 A A C C N N N
3 10 A A C C N N C
4 11 A A N N N N C
5 12 N N N N N N C
谢谢您的帮助。您可以使用
seq
功能获取奇数和偶数位置:
names(genalex)[seq(2,ncol(genalex),2)] <- names(table)
names(genalex)[seq(1,ncol(genalex),2)] <- ""
names(genalex)[1] <- "Ind"
names(genalex)[seq(2,ncol(genalex),2)]谢谢;为了清楚起见,小数被用作空格的占位符?在R?@user3545679:decimals中,这些仍然被视为空白?我不明白你的问题。我没有在“空白”列中用空格,而是用小数点作为标题。当我尝试添加NA而不是空格时,使用以下代码:names(genalex)[seq(1,ncol(genalex),2)]我不确定为什么会发生这种情况。尝试将所有列设置为“”:名称(genalex)