如何在loop-R中使用grepl函数中的变量_R_Loops_Variables

如何在loop-R中使用grepl函数中的变量

r loops variables

如何在loop-R中使用grepl函数中的变量,r,loops,variables,R,Loops,Variables,我是R新手，在循环和grepl函数方面有一些问题我有一个类似的数据： str(peptidesFilter) 'data.frame': 78389 obs. of 130 variables: $ Sequence : chr "AAAAAIGGR" "AAAAAIGGRPNYYGNEGGR" "AAAAASSNPGGGPEMVR" "AAAAAVGGR" ... $ First.amino.acid : c

我是R新手，在循环和grepl函数方面有一些问题我有一个类似的数据：

str(peptidesFilter)
  'data.frame':   78389 obs. of  130 variables:
 $ Sequence                      : chr  "AAAAAIGGR" "AAAAAIGGRPNYYGNEGGR" "AAAAASSNPGGGPEMVR" "AAAAAVGGR" ...
 $ First.amino.acid              : chr  "A" "A" "A" "A" ...
 $ Protein.group.IDs             : chr  "1" "1;2;4" "2;5 "3" "4;80" ...

我想使用下面的grepl函数根据$Protein.group.IDs过滤数据

    peptidesFilter.new <- peptidesFilter[grepl('(^|;)2($|;)',
peptidesFilter$Protein.group.IDs),]

peptidesFilter.new对于grepl问题，您可以使用paste0
例如：
paste0('(^|;)',i,'($|;)')

对于循环，您可以这样做：
ll <- lapply(seq(1:4),function(x)
         peptidesFilter[grepl(paste0('(^|;)',x,'($|;)'),
                           peptidesFilter$Protein.group.IDs),])

对于grepl问题，您可以使用paste0
例如：
paste0('(^|;)',i,'($|;)')

对于循环，您可以这样做：
ll <- lapply(seq(1:4),function(x)
         peptidesFilter[grepl(paste0('(^|;)',x,'($|;)'),
                           peptidesFilter$Protein.group.IDs),])

非常感谢！paste0（“（^ |）”，i“（$）”）解决了grep1问题，我无法理解的是lapply，基本上我想基于ID分割数据，然后进一步处理每个分割的数据。例如，Sequence信息。do.call（rbind，ll），它再次合并所有数据。当x=1、x=2等时，是否可以创建单个数据帧（如肽过滤器X1、肽过滤器X2等）。。。还是我看错你了？@Samir我想名单就是你想要的。对不起，我现在明白了。非常感谢，非常感谢！paste0（“（^ |）”，i“（$）”）解决了grep1问题，我无法理解的是lapply，基本上我想基于ID分割数据，然后进一步处理每个分割的数据。例如，Sequence信息。do.call（rbind，ll），它再次合并所有数据。当x=1、x=2等时，是否可以创建单个数据帧（如肽过滤器X1、肽过滤器X2等）。。。还是我看错你了？@Samir我想名单就是你想要的。对不起，我现在明白了。非常感谢