对R中数据帧中的特定值使用表摘要

你好，我有一个df，例如：

query    G1 G2 G3 G4 G5
SP1      A  B  NA NA B
SP2      B  F  NA G  NA
SP3      NA NA NA C  B
SP4      NA NA NA C  C

我想为每个SPN计算A和B的单元数

例如，对于SP1，有3个 对于SP2:1 等，我应该得到

    nb
SP1 3
SP2 1
SP3 1
SP4 0

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谢谢你的帮助

你想要这样的东西吗

df<-data.frame(G1=c("A","B", NA, NA), G2=c("B","F",NA,NA),G3=c(NA,NA,NA,NA),G4=c(NA,"G","C","C"),G5=c("B",NA,"B","C"))
rownames(df)<-c("SP1","SP2","SP3","SP4")
data.frame(nb=apply(df, 1,function(x) sum(x %in% c("A","B") )))

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你想要这样的东西吗

df<-data.frame(G1=c("A","B", NA, NA), G2=c("B","F",NA,NA),G3=c(NA,NA,NA,NA),G4=c(NA,"G","C","C"),G5=c("B",NA,"B","C"))
rownames(df)<-c("SP1","SP2","SP3","SP4")
data.frame(nb=apply(df, 1,function(x) sum(x %in% c("A","B") )))

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使用tidyverse，这是否有效：

library(tidyr)
library(dplyr)
library(stringr)
df %>% rownames_to_column('SP') %>% 
   mutate(across(everything(),~ replace_na(.,'0'))) %>% 
   unite(new,-SP,sep='') %>% mutate(nb= str_count(new,'A|B')) %>% 
   column_to_rownames('SP') %>% select(2)
    nb
SP1  3
SP2  1
SP3  1
SP4  0

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使用tidyverse，这是否有效：

library(tidyr)
library(dplyr)
library(stringr)
df %>% rownames_to_column('SP') %>% 
   mutate(across(everything(),~ replace_na(.,'0'))) %>% 
   unite(new,-SP,sep='') %>% mutate(nb= str_count(new,'A|B')) %>% 
   column_to_rownames('SP') %>% select(2)
    nb
SP1  3
SP2  1
SP3  1
SP4  0

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为了完整起见，我添加以下内容作为答案：

>%cA，B，nrow=nrowdf，dimnames=listdf$query中的rowsumsmatrix.matrixdf%，NULL >SP1 SP2 SP3 SP4 > 3 1 1 0

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为了完整起见，我添加以下内容作为答案：

>%cA，B，nrow=nrowdf，dimnames=listdf$query中的rowsumsmatrix.matrixdf%，NULL >SP1 SP2 SP3 SP4 > 3 1 1 0

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您好，如果sp名称为query的列是query怎么办？我试图用查询替换“SP”，但它不起作用，我使用了rownames\u to\u列，因为dplyr不携带rownames，所以我们从rownames创建了一个列，最后，我们将该列作为rownames重新存储。您好，如果使用SP名称的列是query怎么办？我试图用query替换'SP'，但它不起作用，我使用了rownames_to_列，因为dplyr不携带rownames，所以我们从rownames创建了一个列，最后，我们将该列作为rownames返回。