Warning: file_get_contents(/data/phpspider/zhask/data//catemap/4/oop/2.json): failed to open stream: No such file or directory in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 167

Warning: Invalid argument supplied for foreach() in /data/phpspider/zhask/libs/tag.function.php on line 1116

Notice: Undefined index: in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 180

Warning: array_chunk() expects parameter 1 to be array, null given in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 181
基于特定列中的模式的grep_R - Fatal编程技术网

基于特定列中的模式的grep

基于特定列中的模式的grep,r,R,我想grep包含V21列中字符串hsa的行。 尝试了类似这样的方法:greppattern=hsa,文件$V21,但是,这不起作用 V2 V10 V21 1 16 AGCTTCCAGTCGAGGATGTTTACA XF:Z:hsa-miR-30a-5p 2 16 AGTGTGAGTTCTACCATTGCCAAA 3 16 AGTGAATTCTACCAGTGCCATA

我想grep包含V21列中字符串hsa的行。 尝试了类似这样的方法:greppattern=hsa,文件$V21,但是,这不起作用

  V2                      V10                 V21
1 16 AGCTTCCAGTCGAGGATGTTTACA XF:Z:hsa-miR-30a-5p
2 16 AGTGTGAGTTCTACCATTGCCAAA                    
3 16   AGTGAATTCTACCAGTGCCATA                    
4  0   TAGCTTATCAGACTGATGTTGA                    
5 16  GCTTCCAGTCGAGGATGTTTACA XF:Z:hsa-miR-30a-5p
6  0   TGAGGTAGTAGATTGTATAGTT  XF:Z:hsa-let-7f-5p
输出:

      V2                      V10                 V21
    1 16 AGCTTCCAGTCGAGGATGTTTACA XF:Z:hsa-miR-30a-5p
    5 16  GCTTCCAGTCGAGGATGTTTACA XF:Z:hsa-miR-30a-5p
    6  0   TGAGGTAGTAGATTGTATAGTT  XF:Z:hsa-let-7f-5p

在我看来是正确的。您看到的问题是什么?OP可能忘记嵌入到文件中了?像file[greppattern=hsa,file$V21,]之类的东西,也许?