Warning: file_get_contents(/data/phpspider/zhask/data//catemap/4/r/82.json): failed to open stream: No such file or directory in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 167

Warning: Invalid argument supplied for foreach() in /data/phpspider/zhask/libs/tag.function.php on line 1116

Notice: Undefined index: in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 180

Warning: array_chunk() expects parameter 1 to be array, null given in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 181
我如何计算“的数量？”；ATC"；在r_R - Fatal编程技术网
Fatal编程技术网
  • r/
  • 我如何计算“的数量？”；ATC"；在r

我如何计算“的数量？”；ATC"；在r

r

我如何计算“的数量？”；ATC"；在r,r,R,我有一个包含dna序列的fasta文件。我想计算“ATC”在我的序列中出现的次数 例如，mydnaOnebase R选项可以是： length(grepRaw("ATC", x, all = TRUE, fixed = TRUE)) [1] 3 另一个base R解决方案是使用gregexpr（） 以致 > lengths(gregexpr("ATC",mydna)) [1] 3 或者使用str\u计数str\u计数（mydna，“ATC”） > lengths(gregexp

我有一个包含dna序列的fasta文件。我想计算“ATC”在我的序列中出现的次数

例如，mydnaOne
base R
选项可以是：

length(grepRaw("ATC", x, all = TRUE, fixed = TRUE))

[1] 3
另一个base R解决方案是使用
gregexpr（）

以致

> lengths(gregexpr("ATC",mydna))
[1] 3
或者使用
str\u计数
str\u计数（mydna，“ATC”）
> lengths(gregexpr("ATC",mydna))
[1] 3