Warning: file_get_contents(/data/phpspider/zhask/data//catemap/2/linux/27.json): failed to open stream: No such file or directory in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 167

Warning: Invalid argument supplied for foreach() in /data/phpspider/zhask/libs/tag.function.php on line 1116

Notice: Undefined index: in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 180

Warning: array_chunk() expects parameter 1 to be array, null given in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 181
在bash循环中运行R函数_R_Linux_Bash - Fatal编程技术网

在bash循环中运行R函数

在bash循环中运行R函数,r,linux,bash,R,Linux,Bash,我有一个名为ggplot\u cnv.R的脚本,其中包含几个函数 其中一个函数将文件作为输入并输出ggplot2绘图: plot.notch <- function(cnv_file, from=NA, to=NA) { ... } 我想也许你可以用R CMD BATCH来做这样的工作 Usage: R CMD BATCH [options] infile [outfile] 该程序将提供您正在寻找的功能。在中提供了几个示例,可能会将函数名plot.notch和$f作为参数

我有一个名为
ggplot\u cnv.R
的脚本,其中包含几个函数

其中一个函数将文件作为输入并输出ggplot2绘图:

plot.notch <- function(cnv_file, from=NA, to=NA) {
...
}

我想也许你可以用
R CMD BATCH
来做这样的工作

Usage:

     R CMD BATCH [options] infile [outfile]

该程序将提供您正在寻找的功能。在

中提供了几个示例,可能会将函数名
plot.notch
$f
作为参数传递,然后使用
匹配。fun
?可能没有
命令参数
,无法识别
$f
Usage:

     R CMD BATCH [options] infile [outfile]