R 合并2000+；excel文件整合成一个大数据框架

我编写了一个代码，将excel文件合并到一个大数据框架中。代码在处理少量测试文件时运行良好（

by=

参数来自

merge

函数。它会费劲地猜测要合并数据的值。通过在两个函数中查找名称相同的列来继续。听起来好像您正在使用重复的列名结束。这可能与您已显式关闭

check.names

在您的read语句中，您可能会遇到错误的列名。所有文件中是否都有一个共享列名要合并？如果有，请在

merge（）中显式设置
by=

。所有其他列名都是唯一的吗？如果不是，这仍然是一个问题。正如@MrFlick所说，损坏的Excel文件可能包含两个同名的列，并且它也是

合并

尝试加入的列名。它失败，因为它不知道从2（或更多）列中选择哪一列谢谢Flick先生和lukeA。其中一个文件中有一个重复的列，一旦我删除了它，代码就运行得很好。

    library(rJava)
    library (XLConnect)
    data.files = list.files(pattern = "*.xls")
    df = readWorksheetFromFile(file=data.files[1], sheet=1, check.names=F) # Read the         first file

    # Loop through the remaining files and merge them to the existing data frame
    for (file in data.files[-1]) {
        newFile = readWorksheetFromFile(file=file, sheet=1, check.names=F)
    df = merge(df, newFile, all = TRUE, check.names=F)
    }

    write.csv(df, file="Collated_Raw_Files.csv")