使用seqinr翻译FASTA文件中的基因并保留注释
我有一个扁平的使用seqinr翻译FASTA文件中的基因并保留注释,r,bioinformatics,fasta,R,Bioinformatics,Fasta,我有一个扁平的.txt文件,其中包含5个基因。我已使用read.FASTA()在R中将此文件作为FASTA文件读取。然后,我使用getTrans()将每个基因的DNA序列翻译成肽,有效地翻译每个基因序列 然而,一旦序列被翻译,我就失去了每个基因的所有标题或注释,因此我不能轻易地分辨出哪个基因是哪个基因 有什么方法可以在保留注释的同时翻译fasta文件中的多个基因吗?你可以使用名称(肽)来命名翻译后的肽。我按照你的建议做了,效果很好。非常感谢。
.txt
文件,其中包含5个基因。我已使用read.FASTA()
在R中将此文件作为FASTA文件读取。然后,我使用getTrans()
将每个基因的DNA序列翻译成肽,有效地翻译每个基因序列
然而,一旦序列被翻译,我就失去了每个基因的所有标题或注释,因此我不能轻易地分辨出哪个基因是哪个基因
有什么方法可以在保留注释的同时翻译fasta文件中的多个基因吗?你可以使用
名称(肽)来命名翻译后的肽。我按照你的建议做了,效果很好。非常感谢。