Warning: file_get_contents(/data/phpspider/zhask/data//catemap/6/opengl/4.json): failed to open stream: No such file or directory in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 167

Warning: Invalid argument supplied for foreach() in /data/phpspider/zhask/libs/tag.function.php on line 1116

Notice: Undefined index: in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 180

Warning: array_chunk() expects parameter 1 to be array, null given in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 181
使用seqinr翻译FASTA文件中的基因并保留注释_R_Bioinformatics_Fasta - Fatal编程技术网

使用seqinr翻译FASTA文件中的基因并保留注释

使用seqinr翻译FASTA文件中的基因并保留注释,r,bioinformatics,fasta,R,Bioinformatics,Fasta,我有一个扁平的.txt文件,其中包含5个基因。我已使用read.FASTA()在R中将此文件作为FASTA文件读取。然后,我使用getTrans()将每个基因的DNA序列翻译成肽,有效地翻译每个基因序列 然而,一旦序列被翻译,我就失去了每个基因的所有标题或注释,因此我不能轻易地分辨出哪个基因是哪个基因 有什么方法可以在保留注释的同时翻译fasta文件中的多个基因吗?你可以使用名称(肽)来命名翻译后的肽。我按照你的建议做了,效果很好。非常感谢。

我有一个扁平的
.txt
文件,其中包含5个基因。我已使用
read.FASTA()
在R中将此文件作为FASTA文件读取。然后,我使用
getTrans()
将每个基因的DNA序列翻译成肽,有效地翻译每个基因序列

然而,一旦序列被翻译,我就失去了每个基因的所有标题或注释,因此我不能轻易地分辨出哪个基因是哪个基因


有什么方法可以在保留注释的同时翻译fasta文件中的多个基因吗?

你可以使用
名称(肽)来命名翻译后的肽。我按照你的建议做了,效果很好。非常感谢。