Regex 匹配两行中的字符数

我有一个文件，我正试图准备一些下游分析，但我需要两行中的字符数相同。该文件的格式如下所示，其中第2行（

cttataatgccgctctag

）和第4行（

bbbeeeeggggiiighiiigicccb

）需要包含相同数量的字符

@HWI-ST:8:1101:3346:2198#GTCCGC/1
CTTATAATGCCGCTCCCTAAG
+HWI-ST:8:1101:3346:2198#GTCCGC/1
bbbeeeeegggggiiiiiiiiigghiiiiiiiiiiiiiiiiiigeccccb
@HWI-ST:8:1101:10491:2240#GTCCGC/1
GAGTAGGGAGTATACATCAG
+HWI-ST:8:1101:10491:2240#GTCCGC/1
abbceeeeggggfiiiiiigg`gfhfhhifhifdgg^ggdf_`_Y[aa_R
@HWI-ST:8:1101:19449:2134#GTCCGC/1
AAGAAGAGATCTGTGGACCA

到目前为止，我已经从每组四行中抽出第二行，并生成了一个包含每行长度记录的文件，使用：

grep -v '[^A-Z]' file.fastq |awk '{ print length($0); }' > newfile

现在，我正在寻找一种方法来指向这个记录，以指示sed命令从行尾删除多少个字符。类似于：

sed -r 's/.{n}$//' file

---

用一些正则表达式替换n以引用文本文件。我想知道我是否把事情复杂化了，但我需要线条精确匹配，所以我还没有想到另一种方法。任何帮助都会很棒，谢谢

这可能就是您想要的：

awk '
  # If 2nd line of 4-line group, save length as len.
  NR % 4 == 2 { len = length($0) }

  # If 4th line of 4-line group, trim the line to len.
  NR % 4 == 0 { $0 = substr($0, 1, len)}

  # print every line
  { print }
' file

---

这假设文件由4行组组成，其中每个组的第2行和第4行是您感兴趣的。它还假设每个组的第2行不超过其相应的第4行。

是否始终是第2行和第4行？只有这两个？我花了一两秒钟才弄明白背后的逻辑，但是的，这是完美的！非常感谢你的帮助！