linux grep和Ruby之间的差异'；s扫描结果

我有一份DNA序列列表（每行一个）：

ACTGCTCGGGGG

CGCTCGCTTCTC

等

大多数序列包含两个特定的基序，一个靠近开头，一个靠近结尾。我正在提取中间的序列：

使用grep:

grep“motif 1.*motif 2”inputfile>outputfile

在带扫描的ruby中，其中

序列

是一组DNA序列：

 sequences.each do |seq|
  tmp=seq.scan(/motif1.*motif2/)[0]
  outputfile << tmp if tmp
 end

sequences.each do|seq|
tmp=顺序扫描（/Motion1.*Motion2/）[0]
默认情况下，outputfileRuby的
scan
返回一个包含匹配正则表达式部分的数组。Grep不会这样做，如果
color
设置为
auto
，它将返回整行并突出显示匹配项。要仅从检索匹配的零件，请使用
-o
选项

grep -o "motif1.*motif2" inputfile > outputfile

上一个命令应该保存与的扫描相同的输出。
每个命令的输出是什么？我不熟悉ruby，但我猜ruby可能只返回匹配的部分，而grep默认不返回？--无论如何，请尝试
grep-o“pattern”infle>outfile
。