String 复制文件夹名中的空间时，将文件夹名附加到文件名

我一直在使用循环将数据从外部组复制到我的工作目录，并将文件夹名附加到文件名的开头。for循环基于前面的问题。

因为我问了这个问题，外部组简化了他们的文件夹结构，但现在在一些文件夹名称中添加了“（2）”（我无法影响组命名文件的方式，这是一家大型公司）。空间打破了我的循环，我需要帮助修复它

外部组上的文件结构

  Samples/SampleName1/Files/SampleID1_uniqueNumber.gz
  Samples/SampleName2/Files/SampleID2_uniqueNumber.gz
  Samples/SampleName3/Files/SampleID3_uniqueNumber.gz
  Samples/SampleName3 (2)/Files/SampleID3_uniqueNumber.gz

目标文件夹中所需的内容（所有样本移动到单个目标）

我的当前for循环正确地复制了除最后一个示例之外的所有内容。uniqueNumber应足够唯一，以防止2个SampleName3相互覆盖

   for f in ../pathToData/Samples/*/Files/*.gz;
    do s=${f##../pathToData/Samples/}; 
    s=${s%%/*};
    cp $f "/destinationFolder/"$s"."${f##*Files/};
    done

---

如何将空格转义，使cp将“（2）”视为原始文件名的一部分，而不是将“（2）”视为目标文件夹？

与某些编程语言不同，bash可以在引号内进行变量替换。要将变量作为单个参数传递，请将其括在引号中：

cp "$f" [...]

这也适用于命令的其余部分。它可以重写为：

cp "$f" "/destinationFolder/$s.${f##*Files/}";

如果您想按自己的方式进行：

（当它看起来足够好时，删除

echo

命令）

但您不需要任何循环，请看：

输入： （您有一个重复文件：

SampleName3.SampleID3\u uniqueNumber.gz

）

在shell中使用perl的代码： 输出： 当输出看起来良好时，移除

-n

开关

还有其他同名工具可能无法做到这一点，因此请小心。

如果运行以下命令（

GNU

）

您得到的结果包含

Perl脚本、ASCII文本可执行文件

，但不包含

ELF

，那么这似乎是正确的工具=）

如果不是，将其作为

Debian

和类似

Ubuntu

的衍生工具的默认值（通常已经是这种情况）：

$ sudo update-alternatives --set rename /path/to/rename

将

/path/to/rename

替换为

perl rename

可执行文件的路径

---

如果您没有此命令，请搜索您的软件包管理器以安装它，或者（无deps…）

---

---

这个工具最初是由Perl的父亲Larry Wall编写的。

似乎太简单了，我没有想到参数扩展可以在引号中工作。谢谢差不多了，我需要去掉目标文件名中的“（2）”。这是一个单独的问题，因此您应该将此问题重新标记为已回答，然后打开一个新问题。不过，请随时在新问题中链接回此问题。对于此任务，我更喜欢使用不需要更新或特殊安装的工具，因为我正在尝试编写简单的命令，这些命令可供在命令行方面经验很少的人使用（我的问题中没有包含的信息）。但是谢谢你的例子。我提供了两种方法，第一种是你的

for f in Samples/*/Files/*.gz; do
    s=${f##Samples/};
    s=${s%%/*};
    [[ $s =~ [[:space:]] ]] && continue
    echo cp "$f" "/destinationFolder/$s.${f##*Files/}"
done

$ tree Samples/
Samples/
├── SampleName1
│   └── Files
│       └── SampleID1_uniqueNumber.gz
├── SampleName2
│   └── Files
│       └── SampleID2_uniqueNumber.gz
├── SampleName3
│   └── Files
│       └── SampleID3_uniqueNumber.gz
└── SampleName3 (2)
    └── Files
        └── SampleID3_uniqueNumber.gz

8 directories, 4 files

$ shopt -s globstar # enable recursion with '**' require bash --version >= 4
$ rename -n 's|^[^/]+/([^/\s]+)/Files/(.*\.gz)|$1.$2|' Samples/**/*.gz

Samples/SampleName1/Files/SampleID1_uniqueNumber.gz -> SampleName1.SampleID1_uniqueNumber.gz
Samples/SampleName2/Files/SampleID2_uniqueNumber.gz -> SampleName2.SampleID2_uniqueNumber.gz
Samples/SampleName3/Files/SampleID3_uniqueNumber.gz -> SampleName3.SampleID3_uniqueNumber.gz

$ file "$(readlink -f "$(type -p rename)")"

$ sudo update-alternatives --set rename /path/to/rename