3d 科学分子动力学模型的三维可视化软件

我正在写一个程序，将分子动力学实验可视化。输入将是一个文件，其中包含每个原子在每个时间步的位置。将有约100k个原子和约500个时间步。原子将被表示为球体。原子之间的连接将用圆柱体表示

以下是该计划的一些重要要求：

能够移动、旋转和缩放以更改图像 能够在不同的时间步从位置制作电影 使用鼠标选择原子的能力 创建GUI的能力 易于在Mac、Windows和Linux上安装。

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有人能推荐一种语言、可视化库或方法来实现这一点吗？任何其他想法都将不胜感激。

嗯，我认为对于100k原子来说，球体将过于重叠-你将只能看到边缘。所以，我建议用粗体的点来表示原子，用线来表示连接，这样会更快，可以看到更多细节

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在形式上，GPL绘图库及其前端满足您的所有要求。但是，我不确定它会很快吸引100K球体和圆柱体。您需要做的是将所有相关数据以库具有的函数的格式保存，您就完成了。它具有出色的后处理能力，如着色、透明粒子、动画，并且经过良好测试

如果这对你来说似乎不够灵活，我有C++ C++的一些经验，不要被.com弄糊涂，它是免费的和跨平台的。您需要自己为粒子编写OpenGL代码，这非常简单

也就是说，我知道有几种场景图引擎，它们可能会对您有很大帮助，但我认为其他引擎会更好地对此进行评论，因为我从未使用过它们

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参考资料是使用Paraview完成的，您肯定会发现更多的示例，而使用QGLViewer的OpenGL中的示例。

+1供Paraview参考。请注意，还有一个VisIt做类似的工作。此外，请访问我不确定ParaView是否能做到这一点，它会自动为您拉上关系，例如，请参阅，“要求我们推荐或查找工具、库或喜爱的非现场资源的问题对于堆栈溢出来说是离题的，因为它们往往会吸引固执己见的答案和垃圾邮件。相反，到目前为止，我们已经采取了哪些措施来解决它。”