使用awk删除特定空格并替换为分号

我不熟悉linux和命令行。我正在试图找到一个命令，该命令允许我将除第一个以外的所有字段的

空白

（在.csv文本文件中）替换为分号。请看下面的例子，任何帮助都将不胜感激，我已经花了很长时间寻找解决方案。如果你有一个答案，请你解释一下命令，这样我就可以试着了解如何以及为什么。非常感谢

输入文本的示例：

0   k__Bacteria  p__Firmicutes   c__Bacilli             
1   k__Bacteria  p__Firmicutes   c__Clostridia      
2   k__Bacteria  p__Bacteroidetes    c__Bacteroidia     
3   k__Bacteria  p__Bacteroidetes    c__Bacteroidia

我需要输出的是：

0   k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Bacilli        
1   k__Bacteria;p__Firmicutes;c__Clostridia    
2   k__Bacteria;p__Bacteroidetes;c__Bacteroidia   
3   k__Bacteria;p__Bacteroidetes;c__Bacteroidia

---

您可以在python中这样做：

#!/usr/bin/env python
import sys

if __name__ == '__main__':
    for line in sys.stdin:
        cols = line.split()
        print ' '.join([cols[0], ';'.join(cols[1:])])

只需

chmod+xscript

文件并执行它

/script

---

请注意，line.split（）将被多个空格分割，也就是说，

'ab\tc'

将在

['a'，'b'，'c']中产生
您可以在python中这样做：

#!/usr/bin/env python
import sys

if __name__ == '__main__':
    for line in sys.stdin:
        cols = line.split()
        print ' '.join([cols[0], ';'.join(cols[1:])])

只需
chmod+xscript
文件并执行它
/script

请注意，line.split（）将被多个空格分割，也就是说，
'ab\tc'
将在
['a'，'b'，'c']
中产生
解决方案。它可能很脏，有人可以改进它，但它是有效的

awk'OFS=“；”{a=$1；$1=“；$0=a”；“$0}sub（/；；；/，”“，$0）”临时文本文件

输出为

0 k_Bacteria;p_Firmicutes;c_Bacilli
1 k_Bacteria;p_Firmicutes;c_Clostridia
2 k_Bacteria;p_Bacteroidetes;c_Bacteroidia
3 k_Bacteria;p_Bacteroidetes;c_Bacteroidia


编辑：根据评论更新

试试这个awk脚本
myawk.sh

 BEGIN { print "Begin Processing "}
   OFS=";"{
       $9=$9"%%"
   b = $0;
   split($0,a,"%%");
   gsub(/;/," ",a[1])
   print a[1]a[2]
   }
  END {print "Process Complete"}

使用
awk-f myawk.sh temp.txt执行，其中$9是要保留空格的变量uptill
这是解决方案，即
awk
。它可能很脏，有人可以改进它，但它是有效的

awk -v OFS=";" '{$1=$1" "$2;$2="";gsub(/;;/,";",$0);print}' your_file

awk'OFS=“；”{a=$1；$1=“；$0=a”；“$0}sub（/；；；/，”“，$0）”临时文本文件

输出为

0 k_Bacteria;p_Firmicutes;c_Bacilli
1 k_Bacteria;p_Firmicutes;c_Clostridia
2 k_Bacteria;p_Bacteroidetes;c_Bacteroidia
3 k_Bacteria;p_Bacteroidetes;c_Bacteroidia


编辑：根据评论更新

试试这个awk脚本
myawk.sh

 BEGIN { print "Begin Processing "}
   OFS=";"{
       $9=$9"%%"
   b = $0;
   split($0,a,"%%");
   gsub(/;/," ",a[1])
   print a[1]a[2]
   }
  END {print "Process Complete"}

使用
awk-f myawk.sh temp.txt执行，其中$9是要保留空格的变量uptill

awk -v OFS=";" '{$1=$1" "$2;$2="";gsub(/;;/,";",$0);print}' your_file

或者可以是perl语言：

perl -F -lane 'print join ";",@F' your_file| perl -pe 's/;/ /'

或者可以是perl语言：

perl -F -lane 'print join ";",@F' your_file| perl -pe 's/;/ /'

一个简单的问题，假设我有超过上面列出的4个字段（实际上有17个），并且希望保留超过上面所述的第一个字段（即，要保留前9个字段，只保留一个空格，其余字段用分号连接），我可以更改您的awk命令来执行此操作吗？如果是，怎么做？再次非常感谢。这真是一种享受！！非常感谢您的时间和帮助。只为我节省了数小时/数天的转圈时间！！其实我也是awk的新手，花了2个小时来解决你的问题。只是想了解更多。有经验的人应该在开始部分的第二次OFS任务中完成，而不是在身体的状况部分。你不用“b”。如果您想使用这种方法（我不会因为它会占用空白并依赖于%%不在输入中，而是在YMMV中），请完全删除OFS赋值，并将您的gsub（）更改为
gsub（/[[：space:]+/，“；”，a[2]）
。一个简单的问题，假设我有上面列出的4个以上的字段（实际上有17个）并且想要保留比上述第一个字段更多的字段（即，要保留前9个字段，仅保留一个空格，其余字段用分号连接），我可以更改您的awk命令来执行此操作吗？如果是，怎么做？再次非常感谢。这真是一种享受！！非常感谢您的时间和帮助。只为我节省了数小时/数天的转圈时间！！其实我也是awk的新手，花了2个小时来解决你的问题。只是想了解更多。有经验的人应该在开始部分的第二次OFS任务中完成，而不是在身体的状况部分。你不用“b”。如果你想使用这种方法（我不会，因为它会破坏空白，并且依赖于%%不在输入中，而是在YMMV中），完全摆脱OFS赋值，并将你的gsub（）更改为
gsub（/[[：space:]+/，“；”，a[2]）
。非常感谢你的回答。作为linux世界的新手，我没有足够的信心使用python。无论如何谢谢你！非常感谢你的回答。作为linux世界的新手，我没有足够的信心使用python。无论如何谢谢你！嗨，艾德，非常感谢你的回答。不幸的是，它似乎对我不起作用。这可能是因为输入文件是csv文件吗？或者可能有些空白是制表符而不仅仅是普通空格（我认为字段之间的空白可能是我的文件中的制表符和单个空格）？不，也不。最可能的问题是你在Windows上创建了文件，所以其中有虚假的控件Ms。尝试在其上运行dos2unix，然后重新运行我的脚本。若那个不起作用，那个么也许你们正在使用旧的，坏掉的awk-awk-版本告诉你们什么？嗨，再次感谢你们的时间。这个文件是在Ubuntu中创建的，它是几周前才安装的。我是linux新手，所以我还在学习！关于awk版本，我得到了“awk:notapoption:--version”，这是什么意思？您的命令是从my home/user目录运行的。再次感谢。复制/粘贴我发布的示例文件，并在其上运行我的命令，看看是否有效。如果是这样，那么问题是您的输入文件。如果没有，那么问题是你的awk。由于您的awk不支持--version，它的功能已经有问题了，所以我建议您从任何地方下载并安装GNU awk。非常感谢您的帮助，安装了gawk 4.0.1（由于手动安装有问题，最后通过ubuntu软件中心安装），现在您的命令工作正常。谢谢你的时间和耐心。嗨，艾德，非常感谢你的回答。不幸的是，它似乎对我不起作用。这可能是因为输入文件是csv文件吗？或者可能有些空白是制表符而不仅仅是普通空格（我认为字段之间的空白可能是我的文件中的制表符和单个空格）？不，也不。最可能的问题是你在Windows上创建了文件，所以其中有虚假的控件Ms。尝试在其上运行dos2unix，然后重新运行我的脚本。如果那样的话