Installation 安装在Ubuntu上的FreeSurfer

Installation 安装在Ubuntu上的FreeSurfer,installation,ubuntu-12.04,ubuntu-14.04,Installation,Ubuntu 12.04,Ubuntu 14.04,我正在尝试在Ubutun上安装FreeSurfer。我在线遵循安装说明。当我完成这一步时,我有一个问题: Here is your FreeSurfer license. Place the four lines between theCUT HERE markers in a file named "license.txt" in the directory pointed toby the $FREESURFER_HOME environment variable (se

我正在尝试在Ubutun上安装FreeSurfer。我在线遵循安装说明。当我完成这一步时,我有一个问题:

Here is your FreeSurfer license. Place the four lines between theCUT HERE markers in a file named "license.txt" in the directory pointed toby the $FREESURFER_HOME environment variable (see the FreeSurfer documentation).
#---------------CUT HERE--------------- 
xxxxxx

xxxxx

xxxxx

xxxxx
#---------------CUT HERE---------------
这是否意味着我必须将这四行粘贴到名为“license.txt”的文件中?我确实是这样做的。我将这四行粘贴在名为“license.txt”的文件末尾。但当我完成所有步骤并检查安装时。弹出一个错误:

ERROR: FreeSurfer license file /home/urser/Downloads/freesurfer/license.txt not found.

但是license.txt实际上就是所谓的“freesurfer”。我是否误解了说明?

请按照说明操作:

要求 下载和安装 设置环境 清理->这是可选的 注册您的软件 现在在注册并将通过电子邮件发送给您的许可证代码粘贴到此处,请格外小心执行此步骤。

sudo gedit /usr/local/freesurfer/license.txt
我不确定下一步是否必要,但我通常会运行它

sudo ln -s /usr/lib/libtiff.so.{4,3}
结论 总而言之,安装Freesurfer并不难,但在新的linux系统中安装Freesurfer肯定比在Windows中使用虚拟机更好。他们在网站中提供的虚拟机不允许在驻留在主机中的文件中运行命令,这是最终运行虚拟机的关键


请按照说明操作:

要求 下载和安装 设置环境 清理->这是可选的 注册您的软件 现在在注册并将通过电子邮件发送给您的许可证代码粘贴到此处,请格外小心执行此步骤。

sudo gedit /usr/local/freesurfer/license.txt
我不确定下一步是否必要,但我通常会运行它

sudo ln -s /usr/lib/libtiff.so.{4,3}
结论 总而言之,安装Freesurfer并不难,但在新的linux系统中安装Freesurfer肯定比在Windows中使用虚拟机更好。他们在网站中提供的虚拟机不允许在驻留在主机中的文件中运行命令,这是最终运行虚拟机的关键


ls-la/home/user/Downloads/freesurfer/*(不带引号)的输出是什么?@mrunion,绑定commandIs license.txt后有很多文件,其中一个?如果是这样的话,我们对该文件的输出是什么?@mrunion,-rw-rw-r--1个用户Sep 11 12:18/home/user/Downloads/freesurfer/license~-rw-r--1个用户Sep 11 12:28/home/user/Downloads/freesurfer/license.txt--1个用户Sep 11 12:28/home/Downloads/freesurfer/license.txt~·@mrunion,我想我已经解决了这个问题。但是安装还是不好。新的问题是这样的:“ls-la/home/user/Downloads/freesurfer/*”(不带引号)的输出是什么?@mrunion,在绑定了commandIs license.txt之后,有很多文件,其中一个?如果是这样的话,我们对该文件的输出是什么?@mrunion,-rw-rw-r--1个用户Sep 11 12:18/home/user/Downloads/freesurfer/license~-rw-r--1个用户Sep 11 12:28/home/user/Downloads/freesurfer/license.txt--1个用户Sep 11 12:28/home/Downloads/freesurfer/license.txt~·@mrunion,我想我已经解决了这个问题。但是安装还是不好。新问题如下所示:最新使用版本6而不是5.3请参阅最新使用版本6而不是5.3请参阅
sudo gedit /usr/local/freesurfer/license.txt
sudo ln -s /usr/lib/libtiff.so.{4,3}