Macros 将阈值设置为自动阈值的函数

我已经为ImageJ/FIJI编写了一个宏，用于解卷积共焦显微镜图像并运行“3D对象计数器”插件。宏成功运行所有必需的命令，并将所有必需的数据保存在指定位置

然而，我发现3D-OC自动阈值（如插件对话框中所示）过于严格，导致对象丢失或分割。 为了解决这个问题，我想通过一个预先确定的函数来减少autothreshold，类似于这里（from:）所做的，这导致了以下代码：

setAutoThreshold();
   getThreshold(lower,upper);
   v=setThreshold(lower,upper*0.5);
   run("3D Objects Counter", "threshold="v" slice=10 min.=400 max.=20971520 objects statistics summary");

其想法是调用自动阈值，修改它们并将它们设置为变量。但是，当运行这些行时，将返回以下错误：

Number or numeric function expected in line 3.
v=<setThreshold>(lower,upper*0.5);

对于如何将3D-OC阈值指定为所述变量的任何建议或帮助，我们将不胜感激（当然，任何解决方法都是如此：）

干杯

编辑：在测试了下面Jan的回答（效果非常好）之后，我似乎需要调用3D-OC插件设置的阈值。有人知道怎么做吗？

该函数返回所提供变量中的下限和上限阈值。无需为新变量指定任何值，正如您所观察到的，

setThreshold

没有任何返回值

相反，您可以使用从

getThreshold

返回的值，并将其用作

run

方法中的参数（以正确的方式，通过字符串连接，请参阅）：

或者，您可以在第二个参数中使用

&v

，以避免最后一行中的字符串连接（请参阅）：

---

您可能必须使用较低的阈值，而不是较高的阈值，这取决于您是计算明亮对象还是黑暗对象。

Jan，谢谢您。它完全符合规定。然而，我似乎没有从一开始就理解我的问题。ImageJ中的阈值函数都没有返回与3D对象计数器插件相同的下限。您是否知道有什么方法可以调用此插件自动确定的阈值（这样就可以按照上面所述进行处理）？似乎3D Objects Counter正在使用图像堆栈的最后一个切片来生成阈值（请参阅）

Numeric value expected in run() function
Key:"threshold"
Value or variable name:"setThreshold(lower,upper*0.5"

setAutoThreshold();
getThreshold(lower, v);
run("3D Objects Counter", "threshold=" + v + " slice=10 min.=400 max.=20971520 objects statistics summary");

run("3D Objects Counter", "threshold=&v slice=10 min.=400 max.=20971520 objects statistics summary");