将3D Numpy阵列转换为ITK快照

如何将表示医疗数据视频的3D Numpy阵列转换为适合ITK-SNAP应用程序进行手动分割的适当文件格式？

应该是该转换的首选类别。它是模块的一部分，需要在ITK的CMake配置步骤中启用。如果您想使用SimpleTk，应该会有所帮助。一旦您有了一个普通的itk:：Image，您就可以使用支持的多种方法之一将其写入磁盘。

您可以在Paraview中导入3d numpy阵列。 然后将其导出为与ITKSnap兼容的NIH、nifti或analyze文件

将三维阵列保存到vtr文件。您可以按照此链接的说明进行操作。

用Paraview打开文件

对数据应用不同的阈值，取决于问题的数量和范围将不同

对阈值应用不同的颜色和不透明度

想象

获得正确的文件格式后，可以将其加载到ITKSnap中