Python-将字符串中的负小数转换为浮点

我需要读入大量的.txt文件，每个文件都包含一个十进制数（一些是正的，一些是负的），然后将它们附加到2个数组中（基因型和表型）。随后，我希望在scipy中对这些数组执行一些数学运算，但是负（'-'）符号会导致问题。具体来说，我无法将数组转换为float，因为'-'被读取为字符串，导致以下错误：

ValueError: could not convert string to float:

以下是我目前编写的代码：

import linecache

gene_array=[]
phen_array=[]

for i in genotype:

   for j in phenotype:

      genotype='/path/g.txt'
      phenotype='/path/p.txt'

      g=linecache.getline(genotype,1)
      p=linecache.getline(phenotype,1)

      p=p.strip()
      g=g.strip()

      gene_array.append(g)
      phen_array.append(p)

  gene_array=map(float,gene_array)
  phen_array=map(float,phen_array)

在这一点上，我相当确定是负面迹象导致了问题，但我不清楚原因。这里的问题是我使用Linecache吗？有没有更好的替代方法

结果

print gene_array

是

---

错误消息中没有任何内容表明问题出在

-

。最可能的原因是

gene_array

和/或

phen_array

包含空字符串（

'

）

如文档中所述，

linecache.getline（）

将在出现错误时返回

”

（找到的行将包含终止换行符）

---

这个问题绝对不是负面的。Python可以毫无问题地转换带负号的字符串。我建议您针对float RegEx运行每个条目，看看它们是否都通过了。

从错误消息中可以看出，问题似乎是空字符串或空格

ValueError: could not convert string to float:

要使其工作，请将地图转换为列表

gene_array=[float(e) for e in gene_array if e]
phen_array=[float(e) for e in phen_array if e]

用空字符串表示

float（“”

或

float（“”

将给出值错误，因此如果

gene\u数组

或

phen\u数组

中的任何项都有空格，这将在转换为float时引发错误

可能有很多原因导致像这样的空字符串

• 空行还是空行
• 开头或结尾的空行

---

您必须显示您试图读取的实际数据。像

“-123.45”

这样的字符串可以

浮点数
，但是
“-123.45”
不能。你能打印
基因数组和
phen数组吗？也许您的文本文件是空的，您试图
float
一个空字符串？我怀疑这是您的实际代码-在当前形式下，当您在循环内部定义变量时，它会在
for I in genetic
上抛出UnboundLocalError；另外，你从来没有在任何地方使用过
i
或
j
。@jr：你也可以打印
phen\u数组
？我可以
map（float，gene\u数组）
很好……你能解释一下“g和/或p末尾的空字符串”是什么意思吗？每个字符串的结尾都有一个空字符串--在开头和结尾都有一个空字符串。。。OP只是在读第1行（一遍又一遍），这是可疑的…p=p.strip（）（etc）应该处理好空白，不是吗？@mgilson：我的措辞很糟糕。我的意思是
gene\u array
和
phen\u array
，我说的是
g
和
p
@NPE--啊，我现在跟着。是的，一个空字符串可能会有问题——但我不知道OP使用linecache的方式会有什么问题（除非文件中不存在该行）。无论如何，OP似乎对我们并不完全诚实……：）不需要做
条带
，它已经在生成原始列表时完成了。@markransem:同意我错过了那部分谢谢-这就成功了。是的，为了可读性，我必须压缩代码。非常感谢！
gene_array=[float(e) for e in gene_array if e]
phen_array=[float(e) for e in phen_array if e]