Python 如何找到跨越垂直线的图案？

有没有办法在下面的输入中找到上面的模式？它是一种垂直模式，跨越多行文本

5'TCAGATGTATAGAGAGAGAGATCGATTCAGTCAGTTGAAGAGGTGNTACAGA
::     :::       ::        : :     : ||||| :          
3'ATTCAGCCTGCACTCGTACGAGCATGACAGAGAATTGTAGGAGGCTAGGTAGGTAGGTAGGTAGGTAGGTAGG

我尝试了多种方法，但我不确定这是否可能。这不起作用：

N
|
T

---

另外，如果

T

可以是

A

，

T

，

C

，或

G

？

试试这个：

if 'N\n|\nT' in input:
    print('found')

将字符串（我猜是DNA序列和碱基配对模式）拆分为3个字符串的列表，并使用索引沿所有3个字符串进行迭代：

line = "5' TCAGATGTGTATAAGAGACAGTGCGTATTCTCAGTCAGTTGAAGTGNTACAGAA\n            ::     :::       ::        : :     : ||||| :          \n3'          ATTCAGCCTGCACTCGTTACCGAGGCATGACAGAGAATATGTGTAGAGGCGAGCTAAGGTACTTGAAAGGGTGTATTAGAG"

new = line.split('\n')

pos_N = new[0].find('N')

N = 'N'
l = '|'
T = 'T'

for i in range(len(new[0])):
    if (new[0][i] == N):
        if l in new[1][i]:
            if T in new[2][i]:
                print('found')

为了确定模式是否发生在第一条链的最后10个核苷酸内，在相应的范围内迭代：

import re

in_str = '''
5' TCAGATGTGTATAAGAGACAGTGCGTATTCTCAGTCAGTTGAAGTGNTACAGAA
            ::     :::       ::        : :     : ||||| :          
3'          ATTCAGCCTGCACTCGTTACCGAGGCATGACAGAGAATATGTGTAGAGGCGAGCTAAGGTACTTGAAAGGGTGTATTAGAG'''

in_str = re.sub(r'^\s*', "", in_str)
lst = re.split(r'\n', in_str)

acgt = set(['A', 'C', 'G', 'T'])
for idx in range(min([len(s) for s in lst])):
    if lst[0][idx] == 'N' and lst[1][idx] == '|' and lst[2][idx] in acgt:
        print('found!')
        break

---

你的意思是，数据在打印时看起来像你在第一个列表中发布的一样？是的，它是dict中的一个键的值。我不认为你认为你想要的模式是你想要的（在

N

和

|

字符之后没有任何换行符，因为它们是行的中间，但它传达了想法。此文本是确切的字符串还是子字符串（可能是多行字符串/文件的）？这是我想在数百个字典键中搜索的模式-

N

和

是一致的，但是

下面的字符可以是

ATCG

@ggorlen中的任何字符。此模式的结构如下-这是一个字典键的值。欢迎这样做！这假设

pos\N

将匹配管道和它下面的

T

，但它可能不匹配。可能第一个

N

与管道不匹配，而

T

但行组中后面的一个匹配，在这种情况下，这种方法会给出一个假阴性。您确实需要检查第一行中的每个

N

。尝试向asnwer添加原因，以确定是否匹配为什么选择这个以及它如何解决OP问题亲爱的帖木儿-我如何扩展它来检查“|”是否在上字符串的最后10个字符下面？意思是要知道上字符串的最后10个字符是否绑定到另一个字符串-如果您能给我一些帮助，那就太好了-谢谢。@Apex更新了答案。非常感谢：）

len0 = len(lst[0])
offset = 10
for idx in range(len0 - offset, len0):
    if lst[0][idx] == 'N' and lst[1][idx] == '|' and lst[2][idx] in acgt:
        print('found!')
        break