Python 在Matplotlib中选择标记大小

我正在matplotlib中使用方形标记绘制散点图，如下所示：

我想实现这样的目标：

---

这意味着我必须调整标记大小和数字大小/比率，使标记之间没有空白。每个索引单元也应该有一个标记（x和y都是整数），所以如果y从60到100，y方向应该有40个标记。目前我正在手动调整它。你知道实现这一目标的最佳方法是什么吗？

我找到了两种方法：

第一种是基于。基本上，您可以确定相邻数据点之间的像素数，并使用它来设置标记大小。

散点

中的标记大小作为区域给出

fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(111, aspect='equal')

# initialize a plot to determine the distance between the data points in pixel:    
x = [1, 2, 3, 4, 2, 3, 3]
y = [0, 0, 0, 0, 1, 1, 2]
s = 0.0
points = ax.scatter(x,y,s=s,marker='s')
ax.axis([min(x)-1., max(x)+1., min(y)-1., max(y)+1.])

# retrieve the pixel information:
xy_pixels = ax.transData.transform(np.vstack([x,y]).T)
xpix, ypix = xy_pixels.T

# In matplotlib, 0,0 is the lower left corner, whereas it's usually the upper 
# right for most image software, so we'll flip the y-coords
width, height = fig.canvas.get_width_height()
ypix = height - ypix

# this assumes that your data-points are equally spaced
s1 = xpix[1]-xpix[0]

points = ax.scatter(x,y,s=s1**2.,marker='s',edgecolors='none')
ax.axis([min(x)-1., max(x)+1., min(y)-1., max(y)+1.])

fig.savefig('test.png', dpi=fig.dpi)

第一种方法的缺点是符号重叠。我没能找到方法中的缺陷。我可以手动调整

s1

s1 = xpix[1]-xpix[0] - 13. 

以获得更好的结果，但我无法确定

13.

背后的逻辑

因此，第二种方法基于。在这里，在绘图上绘制各个正方形，并相应调整大小。在某种程度上，它是一个手动散点图（一个循环用于构建图形），因此根据数据集，它可能需要一段时间

这种方法使用

补丁

而不是

分散

，因此一定要包括

from matplotlib.patches import Rectangle  

同样，使用相同的数据点：

x = [1, 2, 3, 4, 2, 3, 3]
y = [0, 0, 0, 0, 1, 1, 2]
z = ['b', 'g', 'r', 'c', 'm', 'y', 'k'] # in your case, this is data
dx = [x[1]-x[0]]*len(x)   # assuming equally spaced data-points

# you can use the colormap like this in your case:
# cmap = plt.cm.hot 

fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(111, aspect='equal')
ax.axis([min(x)-1., max(x)+1., min(y)-1., max(y)+1.])

for x, y, c, h in zip(x, y, z, dx):
    ax.add_artist(Rectangle(xy=(x-h/2., y-h/2.), 
                  color=c,             # or, in your case: color=cmap(c)                  
                  width=h, height=h))  # Gives a square of area h*h

fig.savefig('test.png')

在

矩形上有一条注释

：坐标位于左下角，因此

x-h/2。

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这种方法给出了连通的矩形。如果我仔细观察这里的输出，它们似乎仍然重叠了一个像素——同样，我不确定这是否有帮助

改用

plt.imshow

或

plt.pcolor

！用

np.nan

填充空数据位置或使用屏蔽数组。colormap如何处理坏值由

set\u bad

@tcaswell控制，我没有空数据那么图形中没有标记的空格是什么？@DavidZwicker，使用plt.imshow或plt.color，我必须对数据进行转换（将其转换为2D形式）。我还可以在绘图中计算出图形/标记的大小，因此我不必更改代码。我只是找到了。在更具空间性的装箱下，还列出了另一个选项，@elyase