我正在用Python打开3个文件。两个读取的文件都很好；用开放的；但是写入文件只能使用；开放式；

更新：当我今天尝试获取一个最小的程序时，我意识到有一个

os.system（'cmd/k'）

行可能导致了这个问题。我不知道为什么，但当我使用打开的

时，它必须自动关闭文件@谢谢你的建议

我是python新手，所以我可能缺少一些基本的东西，尽管我已经运行了教程并搜索了“with”和“open”。在下面的两段代码中，除了以下几行之外，不应更改任何内容（代码的其余部分主要是注释，我在其中勾勒出了我最终要做的事情以及变量声明和初始化）：

将open（fileDirectory+sigMatchFile，“w”）作为sigMatch:
，它不会在文件中给出输出

sigMatch=open（fileDirectory+sigMatchFile，“w”）
在文件中给出输出

还有缩进（我回去试着确保空行缩进与编程行匹配，虽然我不确定这是个问题，但没有帮助。）

“with open”适用于读取文件，但我无法使其适用于写入文件


使用with open for sigMatch:生成空文件的代码。

使用openforsigmatch:生成具有写入输出的文件的代码。
我不确定问题出在哪里，但我只想指出，
close
在第一段代码中不是必需的。使用
with
with

with file objects的原因是

with

在退出

with

块时会自动为您关闭文件。谢谢-我确实意识到

with

将关闭文件-我只是试图使代码段尽可能相似，看看我是否能找出为什么它没有关闭工作我正在认真考虑只使用

open

来编写文件，但我担心它稍后会咬到我，因为有一些环境问题我不明白。顺便说一下：我建议使用

os.path.join（）

而不是自己连接字符串来获取文件路径。我有一个猜测，它不会刷新，但事实上它会刷新，这是有道理的。我不确定是什么问题。请提供一个。以防万一，如果fileDirectory代表python文件所在的文件夹，则可以使用“.\”+sigMatchFile。

with open(fileDirectory+sigMatchFile, "w") as sigMatch:
    sigMatch.write("1 - Testing if opened\n")

    with open(fileDirectory+currentFastaFile, "r") as fasta:
        fl = fasta.readline().split("|")
        currentGene = fl[1]
        fasta.close()
    sigMatch.write("2 - Testing if still open\n")

    with open(fileDirectory+blastpFile, "r")as blastp:
        blpl = blastp.readlines()
        for x in blpl:
            if "significant alignments:" in x:
                print ("significant alignments: " + x)
                sigMatch.write("3 - Testing if still open\n")
                sigMatch.write("significant alignments: " + x +"\n")

        blastp.close()
    sigMatch.close()

sigMatch = open(fileDirectory+sigMatchFile, "w")
sigMatch.write("1 - Testing if opened\n")

with open(fileDirectory+currentFastaFile, "r") as fasta:
    fl = fasta.readline().split("|")
    currentGene = fl[1]
    fasta.close()
sigMatch.write("2 - Testing if still open\n")

with open(fileDirectory+blastpFile, "r")as blastp:
    blpl = blastp.readlines()
    for x in blpl:
        if "significant alignments:" in x:
            print ("significant alignments: " + x)
            sigMatch.write("3 - Testing if still open\n")
            sigMatch.write("significant alignments: " + x +"\n")

    blastp.close()
sigMatch.close()