Python 获取Numpys掩码数组中的非掩码值

Python 获取Numpys掩码数组中的非掩码值,python,performance,numpy,data-science,masked-array,Python,Performance,Numpy,Data Science,Masked Array,我正在尝试从netCDF4文件中提取数据。这些包含“面具光线”,它们是Numpy库的一部分 我的数据包含:纬度、经度、日期和值(在不同的文件中分开)。 另外,一个显示由于各种原因(无测量或其他原因)哪些纬度/经度无效的遮罩 我的数据如下所示(对于屏蔽数据): 我正在搜索一个numpy方法(或类似方法),它只能提取这些未被屏蔽的值。理想情况下,只需从数据集中删除所有无效条目。 我找到了.compressed,但它返回了一维数组。从第三维度来看,这是一个相当大的信息损失,我不知道这些值在哪里 此外,

我正在尝试从netCDF4文件中提取数据。这些包含“面具光线”,它们是Numpy库的一部分

我的数据包含:纬度、经度、日期和值(在不同的文件中分开)。 另外,一个显示由于各种原因(无测量或其他原因)哪些纬度/经度无效的遮罩

我的数据如下所示(对于屏蔽数据):

我正在搜索一个numpy方法(或类似方法),它只能提取这些未被屏蔽的值。理想情况下,只需从数据集中删除所有无效条目。 我找到了
.compressed
,但它返回了一维数组。从第三维度来看,这是一个相当大的信息损失,我不知道这些值在哪里

此外,我还尝试了
nonzero=_数组['one of the values'][0].nonzero()
。 这给了我一个具有lat/lon值的双数组,但在这之后,我仍然必须访问这些值,这很慢。不幸的是,在知道如何访问所有这些日期后,我需要在30*6个文件上执行这些操作,每个文件具有~1500×700×365个数据点:D

all_days = [(x, rhstmax['stuff'][x][24][1288]) for x in range(366)]
# represents just for lat:24,lon:1288 all days. First 20:
all_days[:20] =
    [(0, 15.799999),
     (1, 16.199999),
     (2, 17.4),
     (3, 13.2),
     (4, 10.8),
     (5, 11.3),
     (6, 15.299999),
     (7, 16.299999),
     (8, 14.099999),
     (9, 10.8),
     (10, 9.5),
     (11, 9.0999994),
     (12, 11.9),
     (13, 9.1999998),
     (14, 31.0),
     (15, 49.0),
     (16, 8.6999998),
     (17, 10.0),
     (18, 44.099998),
     (19, 30.699999)]
# ... takes forever :(

要获取Python中的非屏蔽数据,可以使用
.mask
工具

假设您拥有以下数据集:

data = [[0.0 1.0 -- --]
       [2.0 3.0 -- --]]
通过
data.mask
命令,您可以在获取所有
False
索引的同时获取非屏蔽数据

data = data[data.mask == False]
注意,这将为您提供所有输入的1D数组

data -> [0.0 1.0 2.0 3.0]

如果要删除包含任何/所有屏蔽数据的行:

masked_array(
    data =
     [[[-- -- -- ..., -- -- --]
        ..., 
       [-- -- -- ..., -- -- --]]],
    mask =
     [[[ True  True  True ...,  True  True  True]
        ...,
       [ True  True  True ...,  True  True  True]]],
    fill_value = 32767)
data = data[~data.mask.any(axis=1)]

理想情况下,在删除所有无效条目后,输出的结构是什么?您是否在上检查了此概述?compressed返回1d,因为每行或每列的数值不一致。填充是“删除”屏蔽值的另一种方式。