R 有人有导入HPLC色谱原始数据的方法吗?

R 有人有导入HPLC色谱原始数据的方法吗?,r,import,R,Import,我对探索R中的HPLC原始数据感兴趣 我想探索所有通道(3d和四个2d通道)的完整数据 我正在使用Empower Pro生成数据 导出格式包括 ASCII.arw 友邦保险 OpenLynx.rpt 示例文件位于: 此时,我无法获得有关文件类型结构的信息 使用read.csv等工具,文件似乎不包含3d色谱图数据,或者无法以这种方式导入该数据 多亏了@Ben Bolker,我能够使用“ncdf”包打开到.cdf文件的连接,但它也大多是空的(文件或导入有问题吗?) 读取这些数据非常容易: X

我对探索R中的HPLC原始数据感兴趣

我想探索所有通道(3d和四个2d通道)的完整数据

我正在使用Empower Pro生成数据

导出格式包括

  • ASCII.arw
  • 友邦保险
  • OpenLynx.rpt
示例文件位于:

此时,我无法获得有关文件类型结构的信息

使用read.csv等工具,文件似乎不包含3d色谱图数据,或者无法以这种方式导入该数据


多亏了@Ben Bolker,我能够使用“ncdf”包打开到.cdf文件的连接,但它也大多是空的(文件或导入有问题吗?)

读取这些数据非常容易:

X <- read.csv(url("http://dl.dropbox.com/u/2499934/raw27796.arw"),skip=2,
              header=FALSE)
plot(X$V1,X$V2,type="l")
希望这会有帮助。它确实回答了一个狭隘的问题(“我如何导入这些数据”);也许有人有更多的学科知识可以说你以后会做什么


PS从谷歌上看,“AIA CDF”似乎是NetCDF文件的一种形式;R也有处理该数据格式的工具(同样,
findFn(“NetCDF”)
):另请参见

读取这些数据非常容易:

X <- read.csv(url("http://dl.dropbox.com/u/2499934/raw27796.arw"),skip=2,
              header=FALSE)
plot(X$V1,X$V2,type="l")
希望这会有帮助。它确实回答了一个狭隘的问题(“我如何导入这些数据”);也许有人有更多的学科知识可以说你以后会做什么


PS从谷歌上看,“AIA CDF”似乎是NetCDF文件的一种形式;R也有处理该数据格式的工具(同样,
findFn(“NetCDF”)
):另请参见

再次感谢您提供导入方法!但是,不是所有数据都包含在.arw中(它应该包含),就是不能简单地使用read或scan从.arw文件中完全恢复数据。findFn(“HPLC”)在我的系统上似乎没有产生任何结果(导致找不到临时文件)。然而,你关于NetCDF的提示确实奏效了。我发现了一个过时的包“ncdf”,它至少可以打开这个文件,尽管它无法提取值。我开始认为Empower Pro的原始数据导出是部分的。好吧,很容易看到.arw文件中的内容,因为它只是ASCII文本——双击您的链接可以在浏览器中为我打开它,很明显,那里的信息只有一个x-y值列表。关于
findFn
我的猜测是您使用的是Rstudio--
findFn
在Rstudio中不起作用。。。可悲的是,这看起来更像是一个授权专业问题,而不是一个R问题。我害怕这会是一个授权专业问题!你猜对了,我用的是RStudio。在我解决Empower Pro问题之前删除此问题是否符合礼仪?再次感谢您提供导入方法!但是,不是所有数据都包含在.arw中(它应该包含),就是不能简单地使用read或scan从.arw文件中完全恢复数据。findFn(“HPLC”)在我的系统上似乎没有产生任何结果(导致找不到临时文件)。然而,你关于NetCDF的提示确实奏效了。我发现了一个过时的包“ncdf”,它至少可以打开这个文件,尽管它无法提取值。我开始认为Empower Pro的原始数据导出是部分的。好吧,很容易看到.arw文件中的内容,因为它只是ASCII文本——双击您的链接可以在浏览器中为我打开它,很明显,那里的信息只有一个x-y值列表。关于
findFn
我的猜测是您使用的是Rstudio--
findFn
在Rstudio中不起作用。。。可悲的是,这看起来更像是一个授权专业问题,而不是一个R问题。我害怕这会是一个授权专业问题!你猜对了,我用的是RStudio。在我解决Empower Pro问题之前删除此问题是否符合礼仪?