R 读取文件并使每个字符在单独的列中

我有一个巨大的文件（序列对齐的方形数据文件），我想把每个位置放在一个单独的列中，但例如，

readr:：read_delim

不能使用空分隔符，而对于

readr:：read_fwf

来说，似乎需要指定每个位置？我有35000多个职位

输入文件示例：

EIGMEYRTVSGVAGPLVILDKVKGPKYQEI。。。。。
EIGMEYRTVSGVAGPLVILDKVKGPKYQEI。。。。。
EIGMEYRTVSGVAGPLVILDKVKGPKYQEI。。。。。

输出：

col1 col2 col3 col4 col5 col6。。。。
是的。。。。。
是的。。。。。
是的。。。。。

readr:：read\u fwf

有，您可以使用

col\u positions

参数指定字段宽度。这是一个测试文件，

test.txt

：

Hdvsmf
Dfhjds
Dfhjkd
Dfklds
Dkjffd
Dsfjkd
fkldsf

假设您知道有多少字段，您可以指定字段宽度的向量（1个字符宽，5次，因为此测试文件中有五个字段）：

这可能比为每个字段指定星形和端点位置更容易。您还可以向

fwf_widths

提供列名的字符向量，如：

fwf_widths(rep(1, 5), paste0('col', 1:5))

如果不知道有多少字段，也可以将其作为一个列引入，然后使用来提取列（

sep

参数可以采用数字位置向量，而不仅仅是分隔符）：

---

你说的每个职位是什么意思？给我们一个数据示例以及您希望它看起来像什么。可以使用

readLines（）

，然后使用

strsplit（myDF$myCol，split=”“）

。请提供示例输入文本文件和预期输出。谢谢，我尝试添加了一个示例。但基本上我只想为输入文件中的每个垂直位置/字符创建一个新列。这不像你必须为

read.fwf

键入35000个，只需

widths=rep（13500）

。如果您需要计算字符数，请使用系统命令，例如，

system（“head-n1 yourfile | wc-m”）

如果您使用的是unix-like。啊，太好了！谢谢别担心D:D

fwf_widths(rep(1, 5), paste0('col', 1:5))

# a data frame with everything in one column named blah
df1 = read_csv('test.txt', col_names = 'blah')
field_count = length(df1$blah[1]) # assuming the fields are all same length!

# nb: parentheses for field_count - 1 are super important! you will spend forever debugging this if you miss it
df1 = df1 %>% separate(blah, into = paste0('col', 1:field_count), sep = 1:(field_count - 1))