R：基于数据框中的数据创建一个简单的图表，只需最少的手动输入

我想从一个数据框架中创建一个简单的描述性树形图，只需最少的手工工作

它可能是这样的：

但它需要在每个盒子里都有样本量

我需要以下功能：

基于数据帧生成绘图（而不是显示更多手动选项）

更改分支顺序的能力（例如性别/年龄组/状态与状态/性别/年龄组）

为每个分支添加标签

提供分支的摘要统计信息（例如，雄性\n=200雌性\n=300）计数，或者可能是树中该点的总停留时间

我发现这个tread（）使用了ape软件包，可以进行系统发育树分析，这与我想要的很接近

下面是一个使用“lung”数据集的示例

lung$status <- factor(lung$status)
lung$sex <- factor(lung$sex)
lung$ph.ecog <- factor(lung$ph.ecog)
lung$Age[lung$age >60]<- "60+"; lung$Age[lung$age <=60]<- "<60"
lung$Age <- factor(lung$Age)


library(ape)
newdata <- as.phylo(x=~sex/Age/status/ph.ecog,data=lung)
plot.phylo(x=newdata,show.tip.label=TRUE,show.node.label=TRUE,no.margin=TRUE, root.edge=T)

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lung$status Check out我目前没有这本书，但制作类似图表的代码在Murrell的书《R图形》中：。我猜想，复杂度越来越高的
表
或
tapply
调用可能会用摘要统计信息填充节点。目前还没有数据来检验这一观点。这种情况很可能导致因不清楚或没有MWE而关闭。在发布之前，您应该更加努力地使用R代码构建一个示例。