R 基于列值从列表中选择数据帧
使用R,我试图创建一个新的dataframes列表,仅当其中一列中存在特定的值组合时,才从现有列表中选择dataframes。让我来解释一下第一步的工作原理。这是我在称为df的数据帧中的原始数据:R 基于列值从列表中选择数据帧,r,list,R,List,使用R,我试图创建一个新的dataframes列表,仅当其中一列中存在特定的值组合时,才从现有列表中选择dataframes。让我来解释一下第一步的工作原理。这是我在称为df的数据帧中的原始数据: Taxon C N func.group trophic.grp 1 Chrysomelidae.Phylotreta.exclamationis -30.23 5.06 grazer her
Taxon C N func.group trophic.grp
1 Chrysomelidae.Phylotreta.exclamationis -30.23 5.06 grazer herbivore
2 Chrysomelidae.Neocrepidodera.sp. -27.29 5.55 grazer herbivore
3 Chrysomelidae.Neocrepidodera.sp. -27.84 5.54 grazer herbivore
4 Chrysomelidae.Neocrepidodera.sp. -27.69 4.59 grazer herbivore
5 Mitidulidae.Meligethes.sp. -26.99 5.30 grazer herbivore
6 Chrysomelidae.Phylotreta.sp.2 -28.50 2.40 grazer herbivore
7 Chrysomelidae.Phylotreta.sp.2 -28.36 4.17 grazer herbivore
8 Chrysomelidae.Phylotreta.sp.2 -29.50 3.15 grazer herbivore
9 Chrysomelidae.Phylotreta.sp.2 -27.69 3.72 grazer herbivore
10 Chrysomelidae.Phylotreta.sp.2 -28.22 3.26 grazer herbivore
11 Gastropoda.snail.sp.1 -26.21 3.54 grazer herbivore
12 Gastropoda.snail.sp.1 -27.59 2.61 grazer herbivore
13 Gastropoda.snail.sp.1 -25.10 2.66 grazer herbivore
14 Gastropoda.snail.sp.2 -26.49 2.55 grazer herbivore
15 Gastropoda.snail.sp.4 -27.46 -0.38 grazer herbivore
16 Lepidoptera.Arctidae.Ermine.moth -28.51 2.44 grazer herbivore
17 Curculionidae.Ischapterapion.sp. -29.06 2.19 weevil herbivore
18 Curculionidae.Ischapterapion.sp. -29.27 1.60 weevil herbivore
19 Curculionidae.Ischapterapion.sp. -29.94 2.08 weevil herbivore
20 Curculionidae.Ischapterapion.sp. -29.71 2.16 weevil herbivore
21 Curculionidae.Protapion.sp. -28.45 1.91 weevil herbivore
22 Curculionidae.Protapion.sp. -25.99 0.55 weevil herbivore
23 Curculionidae.Protapion.sp. -28.27 1.52 weevil herbivore
24 Curculionidae.Protapion.sp. -28.01 1.74 weevil herbivore
25 Curculionidae.Protapion.sp. -27.06 0.54 weevil herbivore
26 Curculionidae.Hypera.meles -25.41 3.38 weevil herbivore
27 Curculionidae.Sitona.sp. -27.05 2.01 weevil herbivore
28 Curculionidae.Sitona.sp. -26.70 3.07 weevil herbivore
29 Curculionidae.Sitona.sp. -27.64 2.13 weevil herbivore
30 Curculionidae.Sitona.sp. -27.50 1.47 weevil herbivore
31 Curculionidae.Phylobius.sp. -28.27 2.66 weevil herbivore
32 Curculionidae.Hypera.nigrorostris -25.52 2.43 weevil herbivore
这个数据帧(df)包含14个不同的“分类单元”,其中一些具有多个样本,因此总共有32个样本。每个分类单元也按“功能群”列分类为“食草动物”或“象鼻虫”
首先,我想从我的14个分类单元中随机选择6个分类单元,用于6个分类单元的所有可能组合。因此,有大约3003个6个分类单元的组合,可以从14个分类单元中选出(随机抽样,无需替换,顺序不重要)。对于选择的每个分类单元,我想包括该分类单元的所有样本。我使用此代码,该代码运行良好:
combos<-combn(unique(as.character(df$Taxon)), 6)
mysamples <- apply(combos, 2, function(vec) df[ df$Taxon %in% vec, ] )
combos试试这个代码
mysamples[unlist(lapply(mysamples,
function(x) !any(is.na(match(levels(df$func.group),
x$func.group)))))]
如果缺少食草动物或象鼻虫,match
返回NA,因此any
将返回TRUE,该值为倒数(!),因此此数据帧不会在最后一个数据帧中使用尝试此操作
df.list <- lapply(mysamples,
function(x){if(any(x$func.group=="grazer")&
any(x$func.group=="weevil"))
return(x)})
both <- Filter(Negate(is.null),df.list)
df.list