PETSc-MatLUFactor-不支持此对象类型的此操作

我正在尝试在PETSc中编写LU分解应用程序。我的想法是，程序将打印未分解的矩阵，然后打印分解的矩阵，并计算分解本身所花费的时间

我根据在互联网上找到的少量信息编写了代码（我使用了来自的信息来初始化矩阵），但不幸的是，这还不够。我的代码可以编译，但当我尝试运行它时，它只会大叫以下错误：

[0]PETSC ERROR: --------------------- Error Message --------------------------------------------------------------
[0]PETSC ERROR: No support for this operation for this object type
[0]PETSC ERROR: Mat type mpiaij
[0]PETSC ERROR: See http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html for trouble shooting.
[0]PETSC ERROR: Petsc Release Version 3.5.2, Sep, 08, 2014 
[0]PETSC ERROR: ./petscLUFact on a arch-linux2-c-debug named martin-Aspire-E1-531 by martin Wed Oct 22 22:48:42 2014
[0]PETSC ERROR: Configure options 
[0]PETSC ERROR: #1 MatLUFactor() line 2715 in /home/martin/petsc-3.5.2/src/mat/interface/matrix.c
[0]PETSC ERROR: #2 main() line 49 in petscLUFact.c
[0]PETSC ERROR: ----------------End of Error Message -------send entire error message to petsc-maint@mcs.anl.gov----------
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 56) - process 0

===================================================================================
=   BAD TERMINATION OF ONE OF YOUR APPLICATION PROCESSES
=   EXIT CODE: 56
=   CLEANING UP REMAINING PROCESSES
=   YOU CAN IGNORE THE BELOW CLEANUP MESSAGES
===================================================================================

这个错误是由函数引起的，我想用它进行就地LU分解。问题是，我不知道我的代码到底出了什么问题。我认为，核心问题可能是矩阵变量本身，可能是因为错误的分配（我考虑的是MatmpaiJSetPreAllocation函数），但我不确定

我试图用and替换MatLUFactor函数，但它的效果甚至比MatLUFactor更差，它的错误“更大”：-）

最后，我尝试使用以下命令启动程序：

mpiexec -n 4 ./petscLUFact

因此，如果您知道任何解决方案，我将不胜感激；-）谢谢大家!

注：我一直在寻找可能的解决方案，到目前为止，我找到的最接近的文章是，但提问者使用的是ParMETIS和SuperLU包，据我所知，我没有使用

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这是我的源代码：

static char help[] = "Reads a PETSc matrix and vector from a file and reorders it.\n\
    f0 <input_file> : first file to load (small system)\n\
    -f1 <input_file> : second file to load (larger system)\n\n";

#include <petscsys.h>
#include <petscmat.h>

int main( int argc, char **args ) {
    Mat             A; // 'main' matrix
    PetscInt        r = 2, c = 2; // matrix dimensions (row x col)
    PetscInt        i,j; // coordinates
    PetscInt        Istart, Iend;
    PetscInt        Ii; // counter
    PetscScalar     v; // 2-dimensional array ??? (I'm not sure)
    PetscErrorCode  ierr;

    PetscInitialize( &argc, &args, (char*)0, help );

    // Create matrix
    ierr = MatCreate( PETSC_COMM_WORLD, &A );CHKERRQ( ierr );
    ierr = MatSetSizes( A, PETSC_DECIDE, PETSC_DECIDE, r*c, r*c );CHKERRQ( ierr );
    ierr = MatSetFromOptions(A);CHKERRQ( ierr );
    ierr = MatMPIAIJSetPreallocation( A, 2, PETSC_NULL, 2, PETSC_NULL );CHKERRQ( ierr );
    ierr = MatGetOwnershipRange(A,&Istart,&Iend);CHKERRQ( ierr );

    // INIT matrix
    ierr = MatSetValue( A, 0, 0, 1, INSERT_VALUES ); CHKERRQ( ierr );
    ierr = MatSetValue( A, 0, 1, 2, INSERT_VALUES ); CHKERRQ( ierr );
    ierr = MatSetValue( A, 1, 0, 3, INSERT_VALUES ); CHKERRQ( ierr );
    ierr = MatSetValue( A, 1, 1, 1, INSERT_VALUES ); CHKERRQ( ierr );

    ierr = MatAssemblyBegin( A, MAT_FINAL_ASSEMBLY ); CHKERRQ( ierr );
    ierr = MatAssemblyEnd( A, MAT_FINAL_ASSEMBLY ); CHKERRQ( ierr );

    // Print the matrix
    ierr = MatView( A, PETSC_VIEWER_STDOUT_WORLD ); CHKERRQ( ierr );

    // -----------------
    // LU-decomposition
    // -----------------
    MatFactorInfo mfi;

    // MatFactorInfo mfi INIT
    ierr = MatFactorInfoInitialize( &mfi ); CHKERRQ( ierr );
    mfi.fill = 2;
    mfi.dtcol = 0; 

    IS rowPerm; // variable for row permutations
    IS colPerm; // variable for column permutations

    // Possible replace for MatLUFactor
    /*
    Mat Fact;
    ierr = MatLUFactorSymbolic( Fact, A, rowPerm, colPerm, &mfi );
    ierr = MatLUFactorNumeric( Fact, A, &mfi );
    */      

    // I've read somewhere, that zeros are enough for last three
    // parameters, but it doesn't work too
    //ierr = MatLUFactor( A, 0, 0, 0 ); CHKERRQ( ierr );

    ierr = MatLUFactor( A, rowPerm, colPerm, &mfi );

    ierr = MatView( A, PETSC_VIEWER_STDOUT_WORLD ); CHKERRQ( ierr );

    MatDestroy(&A);

    PetscFinalize();

    return 0;
}

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以下是错误消息：

[0]PETSC ERROR: No support for this operation for this object type
[0]PETSC ERROR: Mat type mpiaij

因此，没有对这个操作的支持，这意味着LU因子分解 垫式MPAIJ。现在我们可以求助于 确实说明内置LU仅适用于顺序矩阵（seqaij）。 它还显示了可用的软件包，如SuperLU和腮腺炎，可以 与PETSc一起用于并行执行LU因子分解。这两者都可以 使用自动安装

--download-superlu --download-mumps

应该是

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--download-superlu_dist——download parmetis——download metis——download mumps——download scalapack——download ptscotch

我尝试下载您和用户1101165推荐的所有软件包，但这会导致另一个问题。除了superlu（我也试过superlu_dist），所有的软件包都还可以（我必须同时安装bison和flex）。在编译superlu包的过程中出现了一个巨大的错误，甚至不适合终端。这是我能看到的部分——它包含大量警告和一个错误（第421行）。你知道这件事的原因吗？我试图查看原始文档，但没有发现任何相关信息。您的编译器不喜欢SuperLU的中止函数，所以只需从配置和使用MUMPS中删除它即可。

--download-superlu --download-mumps