在JavaRCaller中调用R

我正试图通过使用R调用者在java中使用R实现集群。我正在尝试运行集群验证的示例代码，我发现大多数用户都面临一个常见错误：文件过早结束

package test;
import rcaller.RCaller;
import java.io.File;
import java.lang.*;
import java.util.*;
import java.awt.image.DataBuffer;

public class test3 {
    public static void main(String[] args) {
        new test3();
    }

    public test3()
    {

        try{

            RCaller caller = new RCaller();
            caller.cleanRCode();

            caller.setRscriptExecutable("C:/Program Files/R/R-2.15.1/bin/x64/Rscript");
            caller.cleanRCode();

            caller.addRCode("library(clvalid)");
            caller.addRCode("data(mouse)");
            caller.addRCode("express <- mouse [,c(M1,M2,M3,NC1,NC2,NC3)]");
            caller.addRCode("rownames (express) <- mouse$ID ");
            caller.addRCode("intern <- clValid(express, 2:6 , clMethods = c( hierarchical,kmeans,diana,clara,model) ,validation = internal)");
            caller.addRCode("b <- summary(intern) ");
            caller.runAndReturnResult("b");
        }

        catch (Exception e){
            e.printStackTrace();
        }
    }
}

封装测试；
导入rcaller.rcaller；
导入java.io.File；
导入java.lang.*；
导入java.util.*；
导入java.awt.image.DataBuffer；
公共类test3{
公共静态void main（字符串[]args）{
新test3（）；
}
公共测试3（）
{
试一试{
RCaller调用者=新RCaller（）；
caller.cleanRCode（）；
setrscript可执行文件（“C:/Program Files/R/R-2.15.1/bin/x64/Rscript”）；
caller.cleanRCode（）；
addRCode（“库（clvalid）”；
addRCode（“数据（鼠标）”；
addRCode（“express您的代码中有一些拼写错误。例如
clValid
not clValid，并且您遗漏了许多引号，例如“hierarchy”、

我认为最好将代码放在脚本中，并从java中调用它，如下所示：

Runtime.getRuntime().exec("Rscript myScript.R"); 

其中myScript.R是：

library(clValid)
data(mouse)
express <- mouse [,c('M1','M2','M3','NC1','NC2','NC3')]
rownames (express) <- mouse$ID 
intern <- clValid(express, 2:6 , clMethods = c( 'hierarchical','kmeans',
                                               'diana','clara','model') ,
                                                validation = 'internal')
b <- summary(intern) 

库（clValid）
数据（鼠标）
express为什么不使用基于Java的聚类算法，比如ELKI中的算法？我必须用Java打包R脚本。所以在R中执行聚类后，我们必须将其保存为Jar文件。感谢您的回复！！您能告诉我这个Rscript应该写入/存储在哪里吗？。我对R和Java都不熟悉为了避免路径问题，您可以在批处理文件中定义对Rscript的调用，如从java调用，当我从java调用批处理文件时，会显示错误消息“拒绝访问”。此外，我想用java打包R脚本，因此从批处理文件调用R脚本是不够的。