用python解析文件

我正在尝试用python解析一个文件。我有这样一个文件：

ID number        Name
LOI_3456         Bacteria1       
HUI_6478         Bacteria1
PETY_3564        Bacteria1

d2234 d45564 d223098 d50923 PETY_354_d3456 d76533
d2635 PETY_354 d88593 d324623 HUI_6478_d3553d35626
...

所以首先我收集了每个细菌的所有ID_编号：

import re
f = open("file.tsv","r")
f.readline()
for line in f.readlines():
    line = li.rstrip("\n")
    line = li.rsplit("\t")
    ID_number = li[0]

在另一个文件中，我有如下内容：

ID number        Name
LOI_3456         Bacteria1       
HUI_6478         Bacteria1
PETY_3564        Bacteria1

d2234 d45564 d223098 d50923 PETY_354_d3456 d76533
d2635 PETY_354 d88593 d324623 HUI_6478_d3553d35626
...

现在我用同样的脚本写了这个：

   cnt = 0
    f2 = open("file2","r")
    for li in f2.readlines():
        li = li.rstrip("\n")
        pattern_id_number = re.search(ID_number+'_\d+', li)
        if pattern_id number in li:
           print("line :",n, li)

但这不起作用。我想要的是保留与我的pattern_id_成员匹配的行

编辑：

当我这样做时：

if pattern_id :
   print(li)

而不是

if pattern_id in li:
   print(li)

---

没有打印任何内容…

我认为问题在于您在此处构造的正则表达式：

pattern_id_number = re.search(ID_number+'_\d+', li)

Tout

pattern\u id\u number

等于类似于

HUI\u 6478

的值，当您添加

\d+

时，您会得到一个regexp，如：

HUI_6478_\d+

此regexp与第二个文件中的任何内容都不匹配。 我不知道所需的输出，但看起来您需要将regexp创建更新为以下内容：

pattern_id_number = re.search(ID_number + '_\w\d+', li)

然后您将得到一个输出：

line : d2635 PETY_354 d88593 d324623 HUI_6478_d3553d35626

编辑：是的，上面的评论也是有效的，你需要

if pattern_id_number:
   print("line :", li)

---

使用

if pattern\u id\u number:

代替li:中的

if pattern\u id number。也，您可以使用f2中的li的
来迭代
file2
文件中的行。您是说第一个文件的ID号将包含在第二个文件中吗？第一个文件的ID号出现在文件2中的某些行上，但后面有下划线。请注意：您在
pattern\u id\u number=re.search（id\u number+“\u\d+”，li）
，但如果li中的pattern\u id number:
，则在
中检查
pattern\u id number
。看到打字错误了吗？谢谢！很明显…。很抱歉给您带来不便