Python HDFStore异常：找不到正确的atom类型：基本情况

我所面临的问题与中提到的问题相同

我把它简化为熊猫文档中给出的一个例子

本例中的要点是

向
HDFStore
追加
数据帧
，其中包含一些缺少的值。当我使用示例代码时，我最终得到了一个原子类型错误

df_mixed
Out[103]: 
          A         B         C  bool           datetime64  int  string
0 -0.065617 -0.062644 -0.004758  True  2001-01-02 00:00:00    1  string
1  1.444643  1.664311 -0.189095  True  2001-01-02 00:00:00    1  string
2  0.569412 -0.077504 -0.125590  True  2001-01-02 00:00:00    1  string
3       NaN       NaN  0.563939  True                  NaN    1     NaN
4       NaN       NaN -0.618218  True                  NaN    1     NaN
5       NaN       NaN  1.477307  True                  NaN    1     NaN
6 -0.287331  0.984108 -0.514628  True  2001-01-02 00:00:00    1  string
7 -0.244192  0.239775  0.861359  True  2001-01-02 00:00:00    1  string

store=HDFStore('df.h5')
store.append('df_mixed', df_mixed, min_itemsize={'values':50})

...
Exception: cannot find the correct atom type -> [dtype->object,items->Index([datetime64, string], dtype=object)] object of type 'Timestamp' has no len()

如果我按照链接帖子（Jeff的回答）中的建议，对有问题的类型（实际上是
对象
类型）强制执行
dtype
，我仍然会得到相同的错误。我错过了什么

dtypes = [('datetime64', '|S20'), ('string', '|S20')]

store=HDFStore('df.h5')
store.append('df_mixed', df_mixed, dtype=dtypes, min_itemsize={'values':50})

...
Exception: cannot find the correct atom type -> [dtype->object,items->Index([datetime64, string], dtype=object)] object of type 'Timestamp' has no len()

谢谢你的见解

已解决

我使用的是
pandas
0.10，然后切换到0.11-dev。正如杰夫推断的那样，问题在于NaN与NaT的较量

前熊猫版制作

df_mixed.ix[3:5,['A', 'B', 'string', 'datetime64']] = np.nan such that

2  0.569412 -0.077504 -0.125590  True  2001-01-02 00:00:00    1  string
3       NaN       NaN  0.563939  True                  NaN    1     NaN

而后一个版本

2  0.569412 -0.077504 -0.125590  True  2001-01-02 00:00:00    1  string
3       NaN       NaN  0.563939  True                  NaT    1     NaN

问题在于datetime64[ns]系列中的NaN。这些一定是NaT。你是如何构建这个框架的？你用的是什么版本

你能使用0.11-dev吗？（这里还有几个选项）。试试这个：

df['datetime64']=Series（df['datetime64']，dtype='M8[n2]'）

此外，这里还有一些更有用的链接：
您正确地升级到了0-11以获得正确的NaT。我据此编辑了我的文章。谢谢