Python 通过解析后，我得到了损坏的文件

我有很多来自分子动力学代码（Lammps）的输出文件，我有一个脚本，可以解析这些文件并从输出文件中计算出一系列参数。每个文件的大小在4-17MB之间，脚本在大约3分钟内解析768个文件。文件的格式是文本而不是二进制文件

问题是：

在处理其中4到5个文件夹（4~5*768）后，脚本停止，因为它们抱怨整形错误。但真正的原因是，文本中插入了一堆“特殊字符”，没有任何好的理由。我确信，在脚本解析之前，这个文件没有损坏，而将这些字符插入文本中的唯一原因实际上是运行脚本

脚本是用python编写的，我使用下面的“r”键命令来确保脚本没有对文件的写访问权限

fid = open(file_path, 'r') 

我在Matlab中重新编写了相同的脚本，同样的问题也存在，这让我相信这是与我的硬件相关的I/O问题，而不是编码问题

我在ubuntu工作站上运行这个脚本，该工作站有ext4格式的硬盘和64GB的ram。 有趣的是，当我在集群上运行相同的脚本时，我无法复制这个问题。即使这个脚本的并行版本在集群上也运行得很好，没有问题，但在我的本地机器上却不行

下面是脚本的一部分，它对打开的文件执行所有读取操作，文件的其余部分执行计算。最后，我将结果写在一个单独的文件中，这个文件非常小（50KB）

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下面是损坏文件的示例。请注意特殊字符：

99463 2 51.5597 211.814 41.7614k4.26088e-13 -3.35999 
99881 2 52.1696 212.526 39.0575 4.91923e-/ef3 -3.35998 

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如果您有过类似的经历，请在此处留言。

您可以发布一部分损坏的文件和您正在使用的代码吗？如果我们不能准确地看到您正在做什么，那么很难调试。有什么特殊的字符？你说的是

e-13

？不是。我说的是我的文本解释器为表示特殊字符而添加的额外k和/ef。这些字符会改变文件的模式，并导致脚本中出现错误。之后，再次在文本编辑器中打开，文件是否已更改？您还可以确定

md5sum filename

before和after以查看文件校验和是否相同吗？请注意，此问题发生在脚本使用相同格式处理大约3000个文件之后。我无法预测这个问题何时发生。我将尝试在读取每个文件之前和之后获取md5sum的输出。

99463 2 51.5597 211.814 41.7614k4.26088e-13 -3.35999 
99881 2 52.1696 212.526 39.0575 4.91923e-/ef3 -3.35998