Performance MATLAB代码在MacBookPro上运行缓慢，三重while循环

我已经运行了将近六个小时的MATLAB程序，但它仍然没有完成。它在三个while循环中循环（外部两个循环为n=855，内部循环为n=500）。花了这么长时间，这是一个惊喜吗？我能做些什么来提高速度吗？我包括下面的代码，以及下面的变量数据类型

  while i < (numAtoms + 1)
      pointAccessible = ones(numPoints,1);
      j = 1;
      while j <(numAtoms + 1)
          if (i ~= j)
              k=1;
              while k < (numPoints + 1)
                  if (pointAccessible(k) == 1)
                      sphereCoord = [cell2mat(atomX(i)) + p + sphereX(k), cell2mat(atomY(i)) + p + sphereY(k), cell2mat(atomZ(i)) + p + sphereZ(k)];
                      neighborCoord = [cell2mat(atomX(j)), cell2mat(atomY(j)), cell2mat(atomZ(j))];
                      coords(1,:) = [sphereCoord];
                      coords(2,:) = [neighborCoord];
                      if (pdist(coords) < (atomRadius(j) + p))
                          pointAccessible(k)=0;
                      end
                  end
                  k = k + 1;
              end
          end
          j = j+1;
      end
      remainingPoints(i) = sum(pointAccessible);
      i = i +1;
  end

而i<（numtoms+1）
pointAccessible=1（numPoints，1）；
j=1；
当j尝试矢量化它时，看看这里如何处理它：谢谢，这对我来说是新的。我会试着去想这个问题。我的代码有点复杂，因为它包括三个while循环；我试图弄清楚我是否只能“矢量化”内部循环（并将SphereCord和neighborCoord更改为vectors）…首先，您可以用
atomX{I}替换
cell2mat（atomX（I））
-避免为每个元素调用cell2mat的开销-因为这是访问cell-content的正确方式。请从您的问题中删除对MacBook的引用，它们完全无关。计算耗时如此之长表明您需要升级算法，而不是升级计算机。
  numAtoms = 855
  numPoints = 500
  p = 1.4
  atomRadius = <855 * 1 double>
  pointAccessible = <500 * 1 double>
  atomX, atomY, atomZ = <1 * 855 cell>
  sphereX, sphereY, sphereZ = <500 * 1 double>
  remainingPoints = <855 * 1 double>